RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 RGS19P49795 217 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 HTRA3P83110 453 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 BNIP3Q12983 259 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 ODF1Q14990 250 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 LILRA6Q6PI73 481 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 PAOXQ6QHF9 649 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 ZPBP2Q6X784 338 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 USP45Q70EL2 814 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 THAP5Q7Z6K1 395 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 DENND1CQ8IV53 801 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 KIAA1958Q8N8K9 716 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 BRI3BPQ8WY22 251 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC138Q96M89 665 aa2.73□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 IPPKQ9H8X2 491 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 MKNK2Q9HBH9 465 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 CATSPERZQ9NTU4 200 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 L1RE1Q9UN81 338 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 LRCH1Q9Y2L9 728 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 IPPQ9Y573 584 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 FHAD1B1AJZ9 1412 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 GSC2O15499 205 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 NPHS1O60500 1241 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 MGEA5O60502 916 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 EFEMP2O95967 443 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 SLC5A1P13866 664 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 DNM2P50570 870 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 SNX17Q15036 470 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 CHRNA2Q15822 529 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 MZT2AQ6P582 158 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 TLDC1Q6P9B6 456 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 BRINP3Q76B58 766 aa2.73□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 RIOX2Q8IUF8 465 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 JADE3Q92613 823 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 MVB12AQ96EY5 273 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 PTCHD1Q96NR3 888 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 DBNDD2Q9BQY9 259 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 MCMBPQ9BTE3 642 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 PAGR1Q9BTK6 254 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 EPB41L1Q9H4G0 881 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 VTA1Q9NP79 307 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 RASSF1Q9NS23 344 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 EBF1Q9UH73 591 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 X6R8D5 127 aa2.73□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 CUX1P39880 1505 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 ARNTLO00327 626 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 MAFKO60675 156 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 EIF5P55010 431 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 CORO7P57737 925 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 IRF9Q00978 393 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 MSMPQ1L6U9 139 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 DPY19L1Q2PZI1 675 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 KCNK18Q7Z418 384 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC103Q8IW40 242 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 COLGALT2Q8IYK4 626 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM169Q96HH4 297 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 CDIP1Q9H305 208 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 ATP13A1Q9HD20 1204 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 KCNH7Q9NS40 1196 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 PLB1Q6P1J6 1458 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1B0GVC2 190 aa2.72□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 STXBP3O00186 592 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 B3GALT2O43825 422 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 MSCO60682 206 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 ARIH2O95376 493 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 PDCP20941 246 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 SSTR4P31391 388 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 EPHA5P54756 1037 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 ANO6Q4KMQ2 910 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC178Q5BJE1 867 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 PPP4R3AQ6IN85 833 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 CRTC3Q6UUV7 619 aa2.72□□□□□ -1.97
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