RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.31□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR90Q96KV7 1748 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRR19A6NJB7 356 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 UNCXA6NJT0 531 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMTNL1A8MU46 457 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM232C9JQI7 657 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRPA1O75762 1119 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TOMM70O94826 608 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDHBP11177 359 aa6.3□□□□□ -1.4
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PTPRAP18433 802 aa6.3□□□□□ -1.4
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NOVP48745 357 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 GSDMDP57764 484 aa6.3□□□□□ -1.4
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC39A14Q15043 492 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 HGSNATQ68CP4 663 aa6.3□□□□□ -1.4
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR18Q9BV38 432 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 PBX4Q9BYU1 374 aa6.3□□□□□ -1.4
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ARHGEF3-215ENST00000498517 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEPT3Q9UH03 358 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.3□□□□□ -1.4
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NID2Q14112 1375 aa6.3□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM75PA6NK02 468 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CUTAO60888 179 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF202O95125 648 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.29□□□□□ -1.4
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TNNT1P13805 278 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPINK2P20155 84 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCNN1AP37088 669 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ECE1P42892 770 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 STAT2P52630 851 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 BACE1P56817 501 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 NLRP5P59047 1200 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 FKBP1BP68106 108 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 JAG1P78504 1218 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPATQ06203 517 aa6.29□□□□□ -1.4
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ARHGEF3-215ENST00000498517 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NTRK3Q16288 839 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCTD1Q719H9 257 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM160B2Q86V87 743 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ERO1BQ86YB8 467 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 HOMER1Q86YM7 354 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACER1Q8TDN7 264 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 LPAR1Q92633 364 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 MUC3BQ9H195 1237 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ELP3Q9H9T3 547 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 FZD1Q9UP38 647 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SIPA1L1O43166 1804 aa6.29□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A087WWV3 80 aa6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PRG0 241 aa6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 A6NHS1 94 aa6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CXCL11O14625 94 aa6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 IKBKBO14920 756 aa6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 NRDCO43847 1150 aa6.28□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZBED4O75132 1171 aa6.28□□□□□ -1.4
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