RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497022.1

VPS26A-208, Transcript of VPS26, retromer complex component A, human

TSL 3

Gene VPS26A, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VPS26A-208	ENST00000497022	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022		Q6ZSN1	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	ASB1	Q9Y576	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022		B4E1Z4	1266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022		M0R2C6	588 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	PLSCR1	O15162	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	HIP1R	O75146	1068 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	ACRV1	P26436	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	ADCY8	P40145	1251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	DGCR2	P98153	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	IRF9	Q00978	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	CD83	Q01151	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	ASL	P04424	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	C1S	P09871	688 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	MAK	P20794	623 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	IGFALS	P35858	605 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	KCNQ1	P51787	676 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	RRAD	P55042	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	PIF1	Q9H611	641 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	TRAF5	O00463	557 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	OPA1	O60313	960 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	KRT37	O76014	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	HMGCR	P04035	888 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	CR2	P20023	1033 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	SDS	P20132	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	MOGS	Q13724	837 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	ZNF460	Q14592	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	CALML6	Q8TD86	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	PRRX2	Q99811	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022		Q9UFV3	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	DVL2	O14641	736 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	RFPL3	O75679	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	ASMTL	O95671	621 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	TBR1	Q16650	682 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VPS26A-208	ENST00000497022	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS26A-208	ENST00000497022	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VPS26A-208	ENST00000497022	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VPS26A-208	ENST00000497022	KIF11	P52732	1056 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS26A-208	ENST00000497022	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VPS26A-208	ENST00000497022	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
VPS26A-208	ENST00000497022	NFYC	Q13952	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS26A-208	ENST00000497022	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS26A-208	ENST00000497022	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS26A-208	ENST00000497022	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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