RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 EPHA7Q15375 998 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 TM4SF20Q53R12 229 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 LPPQ93052 612 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 OR10A2Q9H208 303 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 HMGXB3Q12766 1538 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 TRAF5O00463 557 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 CR2P20023 1033 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 SELENOPP49908 381 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 SLC6A3Q01959 620 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 AGBL4Q5VU57 503 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 C7orf31Q8N865 590 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 MFSD3Q96ES6 412 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 MAML3Q96JK9 1138 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 GPR42O15529 346 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 KPNA6O60684 536 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 CDC14BO60729 498 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 PRLP01236 227 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 MRE11P49959 708 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 BCAR1P56945 870 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 NFYCQ13952 458 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 PCOLCEQ15113 449 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 PATE3B3GLJ2 98 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 ZNF623O75123 536 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 ZNF20P17024 532 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 SCNN1BP51168 640 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 DGKDQ16760 1214 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 TOMM22Q9NS69 142 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 ENPP3O14638 875 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 MUSKO15146 869 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 CLSTN1O94985 981 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 CD40P25942 277 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 NFKB2Q00653 900 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 RNF151Q2KHN1 245 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 C11orf74Q86VG3 221 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 EFHBQ8N7U6 833 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 DNERQ8NFT8 737 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 C16orf92Q96LL3 132 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 KLC2Q9H0B6 622 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 NELFAQ9H3P2 528 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 ERCC6Q03468 1493 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 SMARCA4P51532 1647 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 F2P00734 622 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 SLC9A1P19634 815 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 STAT5BP51692 787 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 ICAM4Q14773 271 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 TKFCQ3LXA3 575 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 GNRHR2Q96P88 292 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 PTPN18Q99952 460 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 OXSMQ9NWU1 459 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms