RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 TMC6Q7Z403 805 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 KCNK18Q7Z418 384 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 WDR48Q8TAF3 677 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 CLIP3Q96DZ5 547 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 RNF38Q9H0F5 515 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 NFIBO00712 420 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 MPIG6BO95866 241 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 NCAM1P13591 858 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 MC4RP32245 332 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 HTRA3P83110 453 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 PFKPQ01813 784 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 CR1LQ2VPA4 569 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 EDARQ9UNE0 448 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 PLIN1O60240 522 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 HSPA6P17066 643 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 ADKP55263 362 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 MIER2Q8N344 545 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 DLL4Q9NR61 685 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 ERC2O15083 957 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 LPLP06858 475 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 ASGR2P07307 311 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 ECE1P42892 770 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 RGS3P49796 1198 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 SPIDRQ14159 915 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 ANO4Q32M45 955 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 CBLL1Q75N03 491 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 PROSER1Q86XN7 944 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 DGKHQ86XP1 1220 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM209Q96SK2 561 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 BTBD2Q9BX70 525 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 AMNQ9BXJ7 453 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD10Q9H3F6 313 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 MYPNQ86TC9 1320 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 MYL1P05976 194 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 OSMP13725 252 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 VIPR1P32241 457 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 MUM1Q2TAK8 710 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 OBP2AQ9NY56 170 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 VSTM5A8MXK1 200 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFS2O75306 463 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 PFKMP08237 780 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 GPR15P49685 360 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 LGALS4P56470 323 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS50Q9UI38 385 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2C8P10632 490 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 NFATC3Q12968 1075 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 ARTNQ5T4W7 220 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 LIPIQ6XZB0 460 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 DTX3Q8N9I9 347 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 OR10A5Q9H207 317 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 DPP7Q9UHL4 492 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 IRS2Q9Y4H2 1338 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 MAFO75444 373 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 OFD1O75665 1012 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 PFKLP17858 780 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 C5AR1P21730 350 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 FBLN1P23142 703 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 SLC16A1P53985 500 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 TMC5Q6UXY8 1006 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms