RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC1Q9BTT6 524 aa16.99■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HYIQ5T013 277 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLA2G4FQ68DD2 849 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSD17B14Q9BPX1 270 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AKAP3O75969 853 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM13AO94988 1023 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FTCDO95954 541 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CIITAP33076 1130 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACTN2P35609 894 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEA9P43362 315 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGCGQ16739 394 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM20AQ96MK3 541 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH2D4AQ9H788 454 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATAD5Q96QE3 1844 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF40O75150 1001 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ICAM1P05362 532 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPEPPSP55786 919 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIFC3Q9BVG8 833 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa16.98■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIK3CDO00329 1044 aa16.97■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC63Q05C16 580 aa16.97■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.97■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM58Q8NG06 486 aa16.97■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX12Q9UMY4 172 aa16.97■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DOCK5Q9H7D0 1870 aa16.97■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FSTL1Q12841 308 aa16.97■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLPH3Q9H4A6 298 aa16.97■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D12O60347 775 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM49P0CI25 452 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM49CP0CI26 452 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R2P41236 205 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNH2Q12809 1159 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CREG2Q8IUH2 290 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BAP1Q92560 729 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OSBPL9Q96SU4 736 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RMDN3Q96TC7 470 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SELENOOQ9BVL4 669 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOL4O94818 638 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GGCXP38435 758 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR93Q6P2C0 686 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIER3Q7Z3K6 550 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.96■□□□□ 0.31
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa16.96■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYH11P35749 1972 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1W2PQJ5 194 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ODR4Q5SWX8 454 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDXDC1Q6P996 788 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC91Q7Z6B0 441 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM160B2Q86V87 743 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC5A5Q92911 643 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXOC4Q96A65 974 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PACSIN1Q9BY11 444 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSGA10Q9BZW7 698 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ESYT3A0FGR9 886 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLR2O60603 784 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EYA4O95677 639 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP3A4P08684 503 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SFMBT2Q5VUG0 894 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACBD3Q9H3P7 528 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASTN1O14525 1302 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMD2Q13200 908 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP9Q49MG5 647 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC70Q6NSX1 233 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATA4Q8NEY3 305 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEKT3Q9BXF9 490 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC27Q9C0I9 530 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF146Q9NTX7 359 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HPCAL4Q9UM19 191 aa16.95■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADM5C9JUS6 153 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP2K2P36507 400 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTMR1Q13613 665 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNFAIP1Q13829 316 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TKFCQ3LXA3 575 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FIGNQ5HY92 759 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FKBP1CQ5VVH2 108 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MOXD1Q6UVY6 613 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBX3O15119 743 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CETN3O15182 167 aa16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms