RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487620.1

ZNF3-215, Transcript of zinc finger protein 3, human

TSL 2

Gene ZNF3, Length 2,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF3-215	ENST00000487620	SWAP70	Q9UH65	585 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ASTN1	O14525	1302 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	GAK	O14976	1311 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	NRAP	Q86VF7	1730 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SFI1	A8K8P3	1242 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	DNM1L	O00429	736 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	EVI5	O60447	810 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	RASSF9	O75901	435 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	JAM2	P57087	298 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	GTF2I	P78347	998 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	DRP2	Q13474	957 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ERMN	Q8TAM6	284 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SMIM23	A6NLE4	172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CHUK	O15111	745 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	STAT1	P42224	750 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TLDC2	A0PJX2	215 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	C6orf229	H3BNL8	230 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CAND2	O75155	1236 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	FER	P16591	822 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ATP2B4	P23634	1241 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SNAP25	P60880	206 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	DR1	Q01658	176 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	C3orf20	Q8ND61	904 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	GLG1	Q92896	1179 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TATDN2	Q93075	761 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	RAB17	Q9H0T7	212 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PNMA2	Q9UL42	364 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	NENF	Q9UMX5	172 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SHBG	P04278	402 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	RPA1	P27694	616 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SHMT1	P34896	483 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	INTU	Q9ULD6	942 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	KRT13	P13646	458 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ANXA13	P27216	316 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PLTP	P55058	493 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	NPEPPS	P55786	919 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	USH1G	Q495M9	461 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CHADL	Q6NUI6	762 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CEP57	Q86XR8	500 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	RFFL	Q8WZ73	363 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SEC14L1	Q92503	715 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SCLT1	Q96NL6	688 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	POLL	Q9UGP5	575 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PPFIA2	O75334	1257 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PAEP	P09466	180 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SOX5	P35711	763 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SCTR	P47872	440 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PTEN	P60484	403 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SNCB	Q16143	134 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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