RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485604.1

PHF20-212, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene PHF20, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-212ENST00000485604 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 FAM86B1E9PN63 330 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 RFXAPO00287 272 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 MEIS1O00470 390 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 MAFGO15525 162 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 DHX15O43143 795 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 EDIL3O43854 480 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 CCNE2O96020 404 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 CHRNA1P02708 482 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 CTSHP09668 335 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 C1QTNF9P0C862 333 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 CPA1P15085 419 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ADCY7P51828 1080 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ARHGAP4P98171 946 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 PPFIA1Q13136 1202 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 IKBKEQ14164 716 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 LPIN1Q14693 890 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 GRIK4Q16099 956 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 NTRK3Q16288 839 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 CEP55Q53EZ4 464 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 PPM1JQ5JR12 505 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 TAF2Q6P1X5 1199 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 NIPA1Q7RTP0 329 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 PLCD3Q8N3E9 789 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 DBF4BQ8NFT6 615 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ARNTL2Q8WYA1 636 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 SEPT8Q92599 483 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 PGBD1Q96JS3 809 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 MXRA8Q9BRK3 442 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ANO3Q9BYT9 981 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ZMYND12Q9H0C1 365 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 CERS4Q9HA82 394 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 SUGCTQ9HAC7 445 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ERAP1Q9NZ08 941 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 LMCD1Q9NZU5 365 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 TUBE1Q9UJT0 475 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 SSUH2Q9Y2M2 353 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 SNX14Q9Y5W7 946 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa4.96□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 MYO7AQ13402 2215 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ATG7O95352 703 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 FOSP01100 380 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 AMHP03971 560 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 CYP3A4P08684 503 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ARP10275 920 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 GNAT1P11488 350 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 SCG2P13521 617 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 RPS6KB1P23443 525 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ADD1P35611 737 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 RBM25P49756 843 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 NAPAP54920 295 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ACTR2P61160 394 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 SP4Q02446 784 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 APOBRQ0VD83 1088 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 PLCB4Q15147 1175 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 NPY5RQ15761 445 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 FBXO47Q5MNV8 452 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 CCDC82Q8N4S0 544 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 LINC01465Q8N7H1 131 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 KCNG4Q8TDN1 519 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 SEPT1Q8WYJ6 367 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 APBB2Q92870 758 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 TOP1MTQ969P6 601 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ZBTB10Q96DT7 871 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 C17orf80Q9BSJ5 609 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 GLT8D2Q9H1C3 349 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 TMEM260Q9NX78 707 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 SLC9A2Q9UBY0 812 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 INSL6Q9Y581 213 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 V9GY48 417 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ADAMTS20P59510 1910 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa4.95□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.94□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 COL1A2P08123 1366 aa4.94□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 AKAP13Q12802 2813 aa4.94□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 WDR81Q562E7 1941 aa4.94□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 SMCO2A6NFE2 343 aa4.94□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.94□□□□□ -1.62
PHF20-212ENST00000485604 KIF28PB7ZC32 967 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms