RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484657.5

GTPBP1-209, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 4

Gene GTPBP1, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-209	ENST00000484657	MYO10	Q9HD67	2058 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	DENND3	A2RUS2	1198 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	PKN1	Q16512	942 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	SUSD6	Q92537	303 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	EDA	Q92838	391 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	LENG9	Q96B70	501 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	FAM167A	Q96KS9	214 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	CWH43	Q9H720	699 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	MAGEB2	O15479	319 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	CDC45	O75419	566 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	FGF18	O76093	207 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	PSAP	P07602	524 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	LAG3	P18627	525 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	GNA11	P29992	359 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	PLCB3	Q01970	1234 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	NHLH1	Q02575	133 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	KCNC3	Q14003	757 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	DUSP6	Q16828	381 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	UIMC1	Q96RL1	719 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	OSMR	Q99650	979 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	C6orf50	Q9HD87	102 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	RNF19A	Q9NV58	838 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	WDR64	B1ANS9	1081 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	ADAMTS3	O15072	1205 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	HOXA2	O43364	376 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	CSPG5	O95196	566 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	VTN	P04004	478 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	NTRK3	Q16288	839 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	BICD2	Q8TD16	824 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	FBXL18	Q96ME1	805 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	TLE6	Q9H808	572 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	HCST	Q9UBK5	93 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	GINS2	Q9Y248	185 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	USP34	Q70CQ2	3546 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	EDIL3	O43854	480 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZNF862	O60290	1169 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	PPM1A	P35813	382 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	CLCN3	P51790	818 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	EVC	P57679	992 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	ERVFC1	P60507	584 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	APOBR	Q0VD83	1088 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	CASD1	Q96PB1	797 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	MAP7D2	Q96T17	732 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	RIT2	Q99578	217 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-209	ENST00000484657	OAT	P04181	439 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	FGFR1	P11362	822 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	IFNAR1	P17181	557 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	TMOD1	P28289	359 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	HSPA4	P34932	840 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	GPC3	P51654	580 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	PRR16	Q569H4	304 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657		Q6ZUG5	572 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	LRRC43	Q8N309	656 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	METTL13	Q8N6R0	699 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-209	ENST00000484657	RDM1	Q8NG50	284 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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