RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa36.71■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 TMOD1P28289 359 aa36.71■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 STK38Q15208 465 aa36.71■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 IER5Q5VY09 327 aa36.71■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP36.71■■■■□ 3.476e-7■■□□□ 13.4
CHKB-210ENST00000484266 OSBPL7Q9BZF2 842 aa36.71■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 KIAA1024Q9UPX6 916 aa36.71■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 CXCL10P02778 98 aa36.7■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 PFKMP08237 780 aa36.7■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 DRP2Q13474 957 aa36.7■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 TMEM240Q5SV17 173 aa36.7■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 C9orf50Q5SZB4 431 aa36.7■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 ATL3Q6DD88 541 aa36.7■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
CHKB-210ENST00000484266 YEATS4O95619 227 aa36.69■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 RFC5P40937 340 aa36.69■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 ZNF365Q70YC5 407 aa36.69■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 SLC7A3Q8WY07 619 aa36.69■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 MAP7D2Q96T17 732 aa36.69■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 TRPV2Q9Y5S1 764 aa36.69■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 VTNP04004 478 aa36.68■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 SHHQ15465 462 aa36.68■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 HYIQ5T013 277 aa36.68■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 CSRNP2Q9H175 543 aa36.68■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 AKT3Q9Y243 479 aa36.68■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa36.68■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 M0QZ92 97 aa36.68■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 EXOC8Q8IYI6 725 aa36.68■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 TDHQ8IZJ6 230 aa36.68■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 CLIC6Q96NY7 704 aa36.68■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 SPTLC2O15270 562 aa36.67■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 EMC2Q15006 297 aa36.67■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 CABP7Q86V35 215 aa36.67■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 PNMA5Q96PV4 448 aa36.67■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 NUCB2P80303 420 aa36.66■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 GRB10Q13322 594 aa36.66■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa36.66■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 CFAP45Q9UL16 551 aa36.66■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 TCHHQ07283 1943 aa36.65■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 A0A1W2PPC1 479 aa36.65■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 PPP6R2O75170 966 aa36.65■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 DGAT1O75907 488 aa36.65■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 FGBP02675 491 aa36.65■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 UBA7P41226 1012 aa36.65■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 DNM2P50570 870 aa36.65■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 SPECC1Q5M775 1068 aa36.65■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 FBXO47Q5MNV8 452 aa36.65■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 PPP1R16BQ96T49 567 aa36.65■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 CDHR5Q9HBB8 845 aa36.65■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 SLC26A4O43511 780 aa36.64■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 GPR32O75388 356 aa36.64■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 GHRP10912 638 aa36.64■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 KIZQ2M2Z5 673 aa36.64■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 KCNK18Q7Z418 384 aa36.64■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 MTRQ99707 1265 aa36.64■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 NT5C3AQ9H0P0 336 aa36.64■■■■□ 3.46
CHKB-210ENST00000484266 E9PMD0 336 aa36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 GAS2O43903 313 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 LPIN1Q14693 890 aa36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 TCTN1Q2MV58 587 aa36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 TMEM119Q4V9L6 283 aa36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 USP49Q70CQ1 688 aa36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 OTOP2Q7RTS6 562 aa36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 CHAMP1Q96JM3 812 aa36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 BHMT2Q9H2M3 363 aa36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 DNM3Q9UQ16 869 aa36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 GINS2Q9Y248 185 aa36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa36.63■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 USO1O60763 962 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 CNKSR3Q6P9H4 555 aa36.62■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 HERVK_113Q902F9 699 aa36.62■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 TMEM143Q96AN5 459 aa36.62■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 EPSTI1Q96J88 318 aa36.62■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 PLIN2Q99541 437 aa36.62■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 CCSER1Q9C0I3 900 aa36.62■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 ADAMTS10Q9H324 1103 aa36.62■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 SQORQ9Y6N5 450 aa36.62■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 ARHGEF35A5YM69 484 aa36.61■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 EYA4O95677 639 aa36.61■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 GPC3P51654 580 aa36.61■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 ZNF710Q8N1W2 664 aa36.61■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 KCTD17Q8N5Z5 321 aa36.61■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 DBF4BQ8NFT6 615 aa36.61■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa36.61■■■■□ 3.45
CHKB-210ENST00000484266 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
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