RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478037.1

REXO4-205, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, human

TSL 2

Gene REXO4, Length 847 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REXO4-205	ENST00000478037	NLRP5	P59047	1200 aa		28.87	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		28.87	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		28.87	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	FAM228A	Q86W67	206 aa		28.87	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		28.87	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	AAAS	Q9NRG9	546 aa		28.87	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	CD207	Q9UJ71	328 aa		28.87	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	MYO7A	Q13402	2215 aa		28.86	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	MBTPS2	O43462	519 aa		28.86	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		28.86	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	SCLT1	Q96NL6	688 aa		28.86	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	EVPL	Q92817	2033 aa		28.86	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	DCX	O43602	365 aa		28.85	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	GAS7	O60861	476 aa		28.85	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	IFNAR1	P17181	557 aa		28.85	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	CIITA	P33076	1130 aa		28.85	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	NRIP1	P48552	1158 aa		28.85	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	NTRK3	Q16288	839 aa		28.85	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		28.85	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		28.85	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		28.85	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	DISC1	Q9NRI5	854 aa		28.85	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037		C9IYK1	514 aa		28.84	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	MAGEB2	O15479	319 aa		28.84	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	TMOD1	P28289	359 aa		28.84	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	ADAM15	Q13444	863 aa		28.84	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		28.84	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		28.84	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	FBXL16	Q8N461	479 aa		28.84	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		28.84	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	LENG9	Q96B70	501 aa		28.84	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		28.84	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		28.84	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	PRR33	A8MZF0	331 aa		28.83	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	GPR32	O75388	356 aa		28.83	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	OAT	P04181	439 aa		28.83	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	FGFR1	P11362	822 aa		28.83	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	PRKCE	Q02156	737 aa		28.83	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		28.83	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		28.83	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	HCST	Q9UBK5	93 aa		28.83	■■■□□ 2.21
REXO4-205	ENST00000478037	MSH4	O15457	936 aa		28.82	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		28.82	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		28.82	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		28.82	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	CPLX1	O14810	134 aa		28.81	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	EFHB	Q8N7U6	833 aa		28.81	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		28.81	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		28.81	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	TLR9	Q9NR96	1032 aa		28.81	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	ZNF862	O60290	1169 aa		28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	FGF18	O76093	207 aa		28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	JAK3	P52333	1124 aa		28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	RUFY3	Q7L099	469 aa		28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	ABI1	Q8IZP0	508 aa		28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	RNF169	Q8NCN4	708 aa		28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	TBCK	Q8TEA7	893 aa		28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	GJA10	Q969M2	543 aa		28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	RIT2	Q99578	217 aa		28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	TLE6	Q9H808	572 aa		28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	SFN	P31947	248 aa		28.79	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	USP11	P51784	963 aa		28.79	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	UBE3A	Q05086	875 aa		28.79	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		28.79	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	UGCG	Q16739	394 aa		28.79	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		28.79	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		28.79	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	LAG3	P18627	525 aa		28.78	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	STK3	Q13188	491 aa		28.78	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	DSC3	Q14574	896 aa		28.78	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		28.78	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	NLRP7	Q8WX94	980 aa		28.78	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	SLC5A5	Q92911	643 aa		28.78	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		28.78	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	PER2	O15055	1255 aa		28.77	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	HOXA2	O43364	376 aa		28.77	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		28.77	■■■□□ 2.2
REXO4-205	ENST00000478037	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		28.77	■■■□□ 2.2

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