RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 RAB30Q15771 203 aa28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIZQ2M2Z5 673 aa28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 RILPL1Q5EBL4 403 aa28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 HERC6Q8IVU3 1022 aa28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 HSCBQ8IWL3 235 aa28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 MAP7D2Q96T17 732 aa28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 AKT3Q9Y243 479 aa28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 PDCP20941 246 aa28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMOD1P28289 359 aa28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMEM40Q8WWA1 233 aa28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 MSRAQ9UJ68 235 aa28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 SQORQ9Y6N5 450 aa28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 GPR32O75388 356 aa28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 MAFO75444 373 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 FERMT3Q86UX7 667 aa28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP38Q8NB14 1042 aa28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 CEP170P1Q96L14 293 aa28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 OSMRQ99650 979 aa28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMEM265A0A087WTH1 108 aa28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 LYPLA2O95372 231 aa28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 SYT1P21579 422 aa28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMEM266Q2M3C6 531 aa28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 MYOCDQ8IZQ8 938 aa28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 SEMA6BQ9H3T3 888 aa28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 MTMR10Q9NXD2 777 aa28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 CHD7Q9P2D1 2997 aa28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 PADI3Q9ULW8 664 aa28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 MED24O75448 989 aa28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
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ARHGEF3-208ENST00000477440 PAK2Q13177 524 aa28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 MYO9BQ13459 2157 aa28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 AMHP03971 560 aa28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 GPC3P51654 580 aa28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 XKR9Q5GH70 373 aa28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 OTUD6AQ7L8S5 288 aa28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 BRAPQ7Z569 592 aa28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 CATSPER3Q86XQ3 398 aa28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 LINC01599Q8WXQ3 324 aa28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ADAMTS10Q9H324 1103 aa28.36■■■□□ 2.13
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ARHGEF3-208ENST00000477440 LAD1O00515 517 aa28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 RPS6KA5O75582 802 aa28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 GJB5O95377 273 aa28.35■■■□□ 2.13
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ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM117BQ6P1L5 589 aa28.35■■■□□ 2.13
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ARHGEF3-208ENST00000477440 GUCD1Q96NT3 240 aa28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF576Q9H609 170 aa28.35■■■□□ 2.13
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ARHGEF3-208ENST00000477440 PPME1Q9Y570 386 aa28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 MYH15Q9Y2K3 1946 aa28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 TLL1O43897 1013 aa28.34■■■□□ 2.13
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ARHGEF3-208ENST00000477440 PRPHP41219 470 aa28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERMNQ8TAM6 284 aa28.34■■■□□ 2.13
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ERVK-5Q9HDB9 667 aa28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGEF15O94989 841 aa28.33■■■□□ 2.13
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ARHGEF3-208ENST00000477440 DNM2P50570 870 aa28.33■■■□□ 2.13
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ARHGEF3-208ENST00000477440 TMX1Q9H3N1 280 aa28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLC28A3Q9HAS3 691 aa28.33■■■□□ 2.13
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ENPP3O14638 875 aa28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 RPA1P27694 616 aa28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 RESTQ13127 1097 aa28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 EMC2Q15006 297 aa28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 PPP2R2DQ66LE6 453 aa28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 TOP1MTQ969P6 601 aa28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 SCLT1Q96NL6 688 aa28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 MTMR6Q9Y217 621 aa28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 UPP2O95045 317 aa28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 RARRES1P49788 294 aa28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 PDIA5Q14554 519 aa28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 GRIN2CQ14957 1233 aa28.31■■■□□ 2.12
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