RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 PAK2Q13177 524 aa22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 KIZQ2M2Z5 673 aa22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 NEK9Q8TD19 979 aa22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 RAD9AQ99638 391 aa22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 PADI3Q9ULW8 664 aa22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.29■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 POTEMA6NI47 508 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 GPR32O75388 356 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 SLITRK3O94933 977 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 NBR1Q14596 966 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 TPH2Q8IWU9 490 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 TOP1MTQ969P6 601 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 CEP170P1Q96L14 293 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 OSMRQ99650 979 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 PPME1Q9Y570 386 aa22.28■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.27■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 RPS6KA5O75582 802 aa22.27■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 TECP42680 631 aa22.27■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 DNM2P50570 870 aa22.27■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 NPEPPSP55786 919 aa22.27■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.27■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.27■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 MYLIPQ8WY64 445 aa22.27■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.27■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 EYSQ5T1H1 3165 aa22.26■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 ENPP3O14638 875 aa22.26■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 UPP2O95045 317 aa22.26■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 DRP2Q13474 957 aa22.26■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 ODR4Q5SWX8 454 aa22.26■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.26■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 INSL6Q9Y581 213 aa22.26■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 LCHNA4D1U4 455 aa22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 GPR182O15218 404 aa22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 LYPLA2O95372 231 aa22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 GPC3P51654 580 aa22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 TAP1Q03518 808 aa22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 PTGDRQ13258 359 aa22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.25■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB39O15060 712 aa22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGEF15O94989 841 aa22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 RFC5P40937 340 aa22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 CDC42EP1Q00587 391 aa22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 XKR9Q5GH70 373 aa22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 SCLT1Q96NL6 688 aa22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 TMX1Q9H3N1 280 aa22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 TTC3P53804 2025 aa22.24■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 FOSL2P15408 326 aa22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 PDCP20941 246 aa22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 FAM228AQ86W67 206 aa22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 ERMNQ8TAM6 284 aa22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 NLRP7Q8WX94 980 aa22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 YME1L1Q96TA2 773 aa22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.23■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 LAD1O00515 517 aa22.22■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.22■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.22■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 SNX21Q969T3 373 aa22.22■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
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