RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466490.6

SRPRB-201, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SRPRB, Length 2,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-201ENST00000466490 RPTORQ8N122 1335 aa14.61□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 A8MUI8 341 aa14.61□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 AHCYL1O43865 530 aa14.61□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 ACTN1P12814 892 aa14.61□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 GBP1P32455 592 aa14.61□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 KCNK18Q7Z418 384 aa14.61□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.61□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.61□□□□□ -0.07
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SRPRB-201ENST00000466490 SOGA3Q5TF21 947 aa14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.6□□□□□ -0.07
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SRPRB-201ENST00000466490 GGT7Q9UJ14 662 aa14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.6□□□□□ -0.07
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SRPRB-201ENST00000466490 SLC9A1P19634 815 aa14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 TAF11Q15544 211 aa14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 JAMLQ86YT9 394 aa14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 CARD9Q9H257 536 aa14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 POTEMA6NI47 508 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 RASGRF2O14827 1237 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 CETN3O15182 167 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 MFSD5Q6N075 450 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 SEMA4AQ9H3S1 761 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 PARP2Q9UGN5 583 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 SNX24Q9Y343 169 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 KLRF2D3W0D1 207 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 NEFHP12036 1026 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 MAPK7Q13164 816 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 UBE4AQ14139 1066 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 GLG1Q92896 1179 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 TRIM7Q9C029 511 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.59□□□□□ -0.07
SRPRB-201ENST00000466490 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 ATP4AP20648 1035 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 MECOMQ03112 1051 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.089e-36■■■■■ 48.1
SRPRB-201ENST00000466490 CCNB1P14635 433 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 PON1P27169 355 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 PLS1Q14651 629 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 SPATA21Q7Z572 469 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 FITM2Q8N6M3 262 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 LRRC42Q9Y546 428 aa14.58□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 ABLIM1O14639 778 aa14.57□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 GFPT2O94808 682 aa14.57□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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SRPRB-201ENST00000466490 LMNB2Q03252 620 aa14.57□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.57□□□□□ -0.08
SRPRB-201ENST00000466490 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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