RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	19.84	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	LPIN1	Q14693	890 aa		19.84	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		19.84	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		19.84	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	19.84	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	19.84	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	MYO9B	Q13459	2157 aa		19.84	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902		A0A087WWV3	80 aa		19.83	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	EFCAB14	O75071	495 aa		19.83	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		19.83	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		19.83	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	19.83	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		19.83	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		19.83	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	19.83	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	19.83	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		19.83	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	MTMR6	Q9Y217	621 aa		19.83	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	PTPRS	Q13332	1948 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	MED24	O75448	989 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	CD52	P31358	61 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	PRPH	P41219	470 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	RABGGTB	P53611	331 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	REST	Q13127	1097 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	PAK2	Q13177	524 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	PDIA5	Q14554	519 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	USP38	Q8NB14	1042 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	APBB2	Q92870	758 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	SLC9A7	Q96T83	725 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	OSMR	Q99650	979 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	MSRA	Q9UJ68	235 aa		19.82	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	DNAJB2	P25686	324 aa		19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	RFC5	P40937	340 aa		19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	DRP2	Q13474	957 aa		19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	POTEG	Q6S5H5	508 aa		19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	NLRP7	Q8WX94	980 aa		19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	CEP89	Q96ST8	783 aa		19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	PPME1	Q9Y570	386 aa		19.81	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	RPS6KA5	O75582	802 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	LYPLA2	O95372	231 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	AMH	P03971	560 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	RPA1	P27694	616 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	PBX2	P40425	430 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	DEFB103A	P81534	67 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	IL17A	Q16552	155 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	KRT79	Q5XKE5	535 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	NACC1	Q96RE7	527 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	PBX4	Q9BYU1	374 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	PADI3	Q9ULW8	664 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	STK24	Q9Y6E0	443 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		19.8	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	CDH23	Q9H251	3354 aa		19.79	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		19.79	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902		A0A0C4DFX4	3053 aa		19.79	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		19.79	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	PP2D1	A8MPX8	630 aa		19.79	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	GPR32	O75388	356 aa		19.79	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	BMP15	O95972	392 aa		19.79	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	CDC25A	P30304	524 aa		19.79	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	BECN1	Q14457	450 aa		19.79	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	EMC2	Q15006	297 aa		19.79	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	RAB30	Q15771	203 aa		19.79	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		19.79	■□□□□ 0.76
USP19-210	ENST00000465902	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		19.79	■□□□□ 0.76

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