RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 SLC5A5Q92911 643 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 HPS3Q969F9 1004 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GANQ9H2C0 597 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC18Q9H819 358 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 VPS18Q9P253 973 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FEM1BQ9UK73 627 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 HPCAL4Q9UM19 191 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SHTN1A0MZ66 631 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA6BA6NDN3 693 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PMM2O15305 246 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MSH4O15457 936 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 HSF2BPO75031 334 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FAM13AO94988 1023 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MOCS3O95396 460 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 NR3C1P04150 777 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 UCHL3P15374 230 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SCP2P22307 547 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GUCY2CP25092 1073 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 STAT1P42224 750 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ZNF131P52739 623 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ENPEPQ07075 957 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 RPS6KA1Q15418 735 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ZSCAN26Q16670 478 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FAM83AQ86UY5 434 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ACTRT1Q8TDG2 376 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D5Q92609 795 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 LENG9Q96B70 501 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 RUFY1Q96T51 708 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 REEP2Q9BRK0 252 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TLR10Q9BXR5 811 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 STK33Q9BYT3 514 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TMEM206Q9H813 350 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.928e-14■■□□□ 13.4
ACTB-208ENST00000464611 PARVGQ9HBI0 331 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 NLRC4Q9NPP4 1024 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 VAV3Q9UKW4 847 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 DUSP10Q9Y6W6 482 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 H3BQF6 201 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 WNT10BO00744 389 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 EPHB6O15197 1021 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SRGAP2O75044 1071 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PSMD10O75832 226 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 H2AFZP0C0S5 128 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CAPN2P17655 700 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PON1P27169 355 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 LMAN1P49257 510 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GHRHRQ02643 423 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TCP10Q12799 353 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CUL1Q13616 776 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TCEAL1Q15170 157 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CEP55Q53EZ4 464 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 EMC10Q5UCC4 262 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 RINT1Q6NUQ1 792 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 H2AFVQ71UI9 128 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SFR1Q86XK3 245 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CD302Q8IX05 232 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MORC4Q8TE76 937 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FAM81BQ96LP2 452 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CSRNP1Q96S65 589 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GDF3Q9NR23 364 aa9.29□□□□□ -0.92
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