RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 RMDN3Q96TC7 470 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SIX2Q9NPC8 291 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 CYP39A1Q9NYL5 469 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 DNAI1Q9UI46 699 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MYH10P35580 1976 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TRAF5O00463 557 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MAFGO15525 162 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF862O60290 1169 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 ATG7O95352 703 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 NR3C1P04150 777 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 NR3C2P08235 984 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TPM1P09493 284 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 NR2F2P24468 414 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 NCKAP1LP55160 1127 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 MTMR1Q13613 665 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TREML2Q5T2D2 321 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZNB5 142 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 CEP89Q96ST8 783 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 TIPINQ9BVW5 301 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 PICK1Q9NRD5 415 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 CEP72Q9P209 647 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MYO6Q9UM54 1294 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 USP20Q9Y2K6 914 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 MCM3APO60318 1980 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 ADM5C9JUS6 153 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CETN3O15182 167 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PMM2O15305 246 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CHMP2AO43633 222 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 HIP1RO75146 1068 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 STAM2O75886 525 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CCND2P30279 289 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SFNP31947 248 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PRKCIP41743 596 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 VAV2P52735 878 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 JAM2P57087 298 aa6.21□□□□□ -1.42
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