RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454225.1

CITED1-210, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CITED1, Length 716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-210ENST00000454225 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CITED1-210ENST00000454225 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
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CITED1-210ENST00000454225 FAM184AQ8NB25 1140 aa29.02■■■□□ 2.24
CITED1-210ENST00000454225 GDPD5Q8WTR4 605 aa29.02■■■□□ 2.24
CITED1-210ENST00000454225 SH2D3AQ9BRG2 576 aa29.02■■■□□ 2.24
CITED1-210ENST00000454225 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CITED1-210ENST00000454225 TMX1Q9H3N1 280 aa29.02■■■□□ 2.24
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CITED1-210ENST00000454225 NCAPH2Q6IBW4 605 aa29.01■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 C17orf80Q9BSJ5 609 aa29.01■■■□□ 2.23
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CITED1-210ENST00000454225 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
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CITED1-210ENST00000454225 EPHA7Q15375 998 aa28.99■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 PLA2G4FQ68DD2 849 aa28.99■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa28.99■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
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CITED1-210ENST00000454225 FAM228AQ86W67 206 aa28.98■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.98■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 CEP89Q96ST8 783 aa28.98■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 RGL1Q9NZL6 768 aa28.98■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 COL4A6Q14031 1691 aa28.98■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 GPR182O15218 404 aa28.97■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 MGEA5O60502 916 aa28.97■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 DRP2Q13474 957 aa28.97■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 FBXO22Q8NEZ5 403 aa28.97■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 SCLT1Q96NL6 688 aa28.97■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 LXNQ9BS40 222 aa28.97■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 ADAMTS10Q9H324 1103 aa28.97■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa28.96■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 GPC3P51654 580 aa28.96■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 NPAS4Q8IUM7 802 aa28.96■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 FIBCD1Q8N539 461 aa28.96■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 DYDC2Q96IM9 177 aa28.96■■■□□ 2.23
CITED1-210ENST00000454225 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.96■■■□□ 2.23
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CITED1-210ENST00000454225 ZNF710Q8N1W2 664 aa28.95■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 SAMD11Q96NU1 681 aa28.95■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 ADAM2Q99965 735 aa28.95■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 CYP26B1Q9NR63 512 aa28.95■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 NLRC5Q86WI3 1866 aa28.94■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 DGKIO75912 1065 aa28.94■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 TXKP42681 527 aa28.94■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 NLRP7Q8WX94 980 aa28.94■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 MTMR9Q96QG7 549 aa28.94■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 TMEM60Q9H2L4 133 aa28.94■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa28.93■■■□□ 2.22
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CITED1-210ENST00000454225 STAG3L1P0CL83 205 aa28.93■■■□□ 2.22
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CITED1-210ENST00000454225 SARSP49591 514 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 DNM2P50570 870 aa28.93■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
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CITED1-210ENST00000454225 CRIPAKQ8N1N5 446 aa28.93■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 TMX3Q96JJ7 454 aa28.93■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 CEP170P1Q96L14 293 aa28.93■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa28.93■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 LRFN2Q9ULH4 789 aa28.93■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 REV3LO60673 3130 aa28.92■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 YWHABP31946 246 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 TPH2Q8IWU9 490 aa28.92■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 RGS18Q9NS28 235 aa28.92■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 C1orf112Q9NSG2 853 aa28.92■■■□□ 2.22
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