RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.23■■□□□ 1.47
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DNM2P50570 870 aa24.22■■□□□ 1.47
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CDH23Q9H251 3354 aa24.22■■□□□ 1.47
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CEP170P1Q96L14 293 aa24.2■■□□□ 1.46
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RFC5P40937 340 aa24.17■■□□□ 1.46
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FAM228AQ86W67 206 aa24.17■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TMX1Q9H3N1 280 aa24.17■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 COL4A6Q14031 1691 aa24.16■■□□□ 1.46
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IGFBP4P22692 258 aa24.16■■□□□ 1.46
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TECP42680 631 aa24.16■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DRP2Q13474 957 aa24.16■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NBR1Q14596 966 aa24.16■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 STAG3L1P0CL83 205 aa24.15■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.15■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.15■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.15■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.15■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.15■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 COL6A3P12111 3177 aa24.15■■□□□ 1.46
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