RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443667.1

PDZK1-204, Transcript of PDZ domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZK1, Length 1,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1-204ENST00000443667 HAND2P61296 217 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 PPM1JQ5JR12 505 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 LRRC55Q6ZSA7 311 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 C1orf210Q8IVY1 113 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 RTKNQ9BST9 563 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 JMJD4Q9H9V9 463 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 USP18Q9UMW8 372 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 FASNP49327 2511 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 COL4A3Q01955 1670 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 M0QZ92 97 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 ARHGAP33O14559 1287 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 GLULP15104 373 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 FOSBP53539 338 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 LMNB2Q03252 620 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 NEDD9Q14511 834 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 IER5Q5VY09 327 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 KCNT2Q6UVM3 1135 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 AUTS2Q8WXX7 1259 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 ADAM2Q99965 735 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 FOXQ1Q9C009 403 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 GINS2Q9Y248 185 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa10.16□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 DENND3A2RUS2 1198 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 ARHGAP8P85298 464 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 GHRHRQ02643 423 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 KRT17Q04695 432 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 GNPTABQ3T906 1256 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 CCDC149Q6ZUS6 474 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 OTOP3Q7RTS5 596 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 PNMA1Q8ND90 353 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 TTC14Q96N46 770 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 ZNF558Q96NG5 402 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 AMNQ9BXJ7 453 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 CDHR5Q9HBB8 845 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 PARD6AQ9NPB6 346 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 WNT16Q9UBV4 365 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 SIT1Q9Y3P8 196 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 SQORQ9Y6N5 450 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZK1-204ENST00000443667 MIA3Q5JRA6 1907 aa10.15□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 PATJQ8NI35 1801 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 C9IYK1 514 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 FIBPO43427 364 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 CXCL14O95715 111 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 INSRRP14616 1297 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 TGM1P22735 817 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 DMWDQ09019 674 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 ZNF454Q8N9F8 522 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 GPR152Q8TDT2 470 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 GLG1Q92896 1179 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 GPATCH3Q96I76 525 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 RGS18Q9NS28 235 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 DZANK1Q9NVP4 752 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 SPG21Q9NZD8 308 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 NEDD4P46934 1319 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 ZZEF1O43149 2961 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 LAMA4Q16363 1823 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 FGAP02671 866 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 POLR2MP0CAP2 368 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 PPM1AP35813 382 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 KRT76Q01546 638 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 ASPRV1Q53RT3 343 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 GPR149Q86SP6 731 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 CABP7Q86V35 215 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 TBC1D10CQ8IV04 446 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 STAG2Q8N3U4 1231 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 SLC22A17Q8WUG5 538 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 TMEM40Q8WWA1 233 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 CASD1Q96PB1 797 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 PPP1R16BQ96T49 567 aa10.13□□□□□ -0.79
PDZK1-204ENST00000443667 KAT14Q9H8E8 782 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms