RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 CCDC22O60826 627 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 IL10P22301 178 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 URGCPQ8TCY9 931 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
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USP46-201ENST00000441222 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 RAD51Q06609 339 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 BBS9Q3SYG4 887 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP46-201ENST00000441222 BTBD6Q96KE9 485 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 ATG3Q9NT62 314 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 CCNE1P24864 410 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 DAB2P98082 770 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 RBL2Q08999 1139 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 TMEM35BQ8NCS4 154 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP46-201ENST00000441222 SENP1Q9P0U3 644 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 SAAL1Q96ER3 474 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 CCDC159P0C7I6 412 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 PTPROQ16827 1216 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 FAM133AQ8N9E0 248 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 USP21Q9UK80 565 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 RASA4BC9J798 803 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 RASA4O43374 803 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 PLA2G4BP0C869 781 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 KRT72Q14CN4 511 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 HACD3Q9P035 362 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 CLIC4Q9Y696 253 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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USP46-201ENST00000441222 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.12□□□□□ -1.27
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USP46-201ENST00000441222 CEP70Q8NHQ1 597 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 TBCKQ8TEA7 893 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 SCFD1Q8WVM8 642 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 PALMDQ9NP74 551 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 TSPOAP1O95153 1857 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.12□□□□□ -1.27
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USP46-201ENST00000441222 PSMD3O43242 534 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 MMP1P03956 469 aa7.12□□□□□ -1.27
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USP46-201ENST00000441222 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.11□□□□□ -1.27
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USP46-201ENST00000441222 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 C2orf54Q08AI8 447 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 NR5A1Q13285 461 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 CASP8Q14790 479 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-201ENST00000441222 MAPK6Q16659 721 aa7.11□□□□□ -1.27
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