RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439235.5

CHD3-204, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene CHD3, Length 1,263 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3-204ENST00000439235 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.97■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 WDR81Q562E7 1941 aa22.97■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 CABYRO75952 493 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 INSRRP14616 1297 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 GAP43P17677 238 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 PPFIA1Q13136 1202 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 EMC2Q15006 297 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 KCNA10Q16322 511 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 ARMC5Q96C12 935 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 ZNF333Q96JL9 665 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 DRC1Q96MC2 740 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 RNF208Q9H0X6 261 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 PANK4Q9NVE7 773 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 ARID2Q68CP9 1835 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD3-204ENST00000439235 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 BIN1O00499 593 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 HIP1RO75146 1068 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 RHOBTB3O94955 611 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 ASGR1P07306 291 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 TYRO3Q06418 890 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 MTFR1Q15390 333 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 STX1AQ16623 288 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 CEP89Q96ST8 783 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 NRCAMQ92823 1304 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 KBTBD13C9JR72 458 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 MAGEB2O15479 319 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 CHMP4BP1P59074 171 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 COASYQ13057 564 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 MORC3Q14149 939 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 GRIK4Q16099 956 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 KIFAP3Q92845 792 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 PARVGQ9HBI0 331 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 ANO10Q9NW15 660 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 ZNF131P52739 623 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 NLRP12P59046 1061 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 IGBP1P78318 339 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 PSMD2Q13200 908 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 RETREG2Q8NC44 543 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 TCP11Q8WWU5 503 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 DEFB118Q96PH6 123 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 C22orf31O95567 290 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 RSPH10BP0C881 870 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 ACLYP53396 1101 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 EHHADHQ08426 723 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 MAPK7Q13164 816 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 C7orf31Q8N865 590 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 GNAT1P11488 350 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 RTP1P59025 263 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 ISM2Q6H9L7 571 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 SFR1Q86XK3 245 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 DAW1Q8N136 415 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 MYCT1Q8N699 235 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 DACH1Q9UI36 760 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.9■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 DNM1LO00429 736 aa22.9■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 PLS3P13797 630 aa22.9■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 KLRC1P26715 233 aa22.9■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 PPP1R2P41236 205 aa22.9■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 DNM2P50570 870 aa22.9■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 ODR4Q5SWX8 454 aa22.9■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 IER5Q5VY09 327 aa22.9■■□□□ 1.26
CHD3-204ENST00000439235 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms