RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ADRA2BP18089 450 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ATP2B4P23634 1241 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CDK8P49336 464 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 TAX1BP1Q86VP1 789 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CEP95Q96GE4 821 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ABCF3Q9NUQ8 709 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 MYH7BA7E2Y1 1941 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 MEIS1O00470 390 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 MGRN1O60291 552 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 NSMCE1Q8WV22 266 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 RAB34Q9BZG1 259 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 FAM129AQ9BZQ8 928 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 AGAP1Q9UPQ3 857 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 MYH1P12882 1939 aa16.76■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 MYH4Q9Y623 1939 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 FOXO6A8MYZ6 492 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 H2AFZP0C0S5 128 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 KRT13P13646 458 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PSMD2Q13200 908 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 H2AFVQ71UI9 128 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 KIF2BQ8N4N8 673 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CETN3O15182 167 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CLIC2O15247 247 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ADCY7P51828 1080 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 KCNJ2P63252 427 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC50Q8IVM0 306 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CUL5Q93034 780 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 KDM4CQ9H3R0 1056 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 RAD21O60216 631 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PLA2G4BP0C869 781 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PON1P27169 355 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SLC29A2Q14542 456 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 OTUD6AQ7L8S5 288 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 NT5DC3Q86UY8 548 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CERKQ8TCT0 537 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ATP8B4Q8TF62 1192 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 HAS1Q92839 578 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 FAXDC2Q96IV6 333 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 BCS1LQ9Y276 419 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 A8MUI8 341 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 BBOX1O75936 387 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SLC8A1P32418 973 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CASP4P49662 377 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 GALCP54803 685 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 GLYCTKQ8IVS8 523 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SWAP70Q9UH65 585 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PCDHA12Q9UN75 941 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 FGFR4P22455 802 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PPP4CP60510 307 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 DR1Q01658 176 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ANKS4BQ8N8V4 417 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 KCTD10Q9H3F6 313 aa16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 LAMB1P07942 1786 aa16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC189A1A4V9 331 aa16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PAEPP09466 180 aa16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 IL1R1P14778 569 aa16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SLC16A2P36021 539 aa16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CEP63Q96MT8 703 aa16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 AMFRQ9UKV5 643 aa16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa16.73■□□□□ 0.27
SFRP4-201ENST00000436072 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms