RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 SFNP31947 248 aa22.71■■□□□ 1.23
HLA-B-250ENST00000434333 P2RX5Q93086 422 aa22.71■■□□□ 1.23
HLA-B-250ENST00000434333 ADAM2Q99965 735 aa22.71■■□□□ 1.23
HLA-B-250ENST00000434333 CD320Q9NPF0 282 aa22.71■■□□□ 1.23
HLA-B-250ENST00000434333 RGS18Q9NS28 235 aa22.71■■□□□ 1.23
HLA-B-250ENST00000434333 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.71■■□□□ 1.23
HLA-B-250ENST00000434333 GPR182O15218 404 aa22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 MAGEB2O15479 319 aa22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 IL9P15248 144 aa22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 JAK3P52333 1124 aa22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 GALNT17Q6IS24 598 aa22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.7■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 DTNBO60941 627 aa22.69■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 ITGB1P05556 798 aa22.69■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 DNAJB1P25685 340 aa22.69■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 DSC3Q14574 896 aa22.69■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 ODR4Q5SWX8 454 aa22.69■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.69■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.69■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 RDM1Q8NG50 284 aa22.69■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.69■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.69■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.69■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 STK36Q9NRP7 1315 aa22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 STBD1O95210 358 aa22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 LTBRP36941 435 aa22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 HYAL1Q12794 435 aa22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 CEP89Q96ST8 783 aa22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.68■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 DENND3A2RUS2 1198 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 PFKFB2O60825 505 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 CTDNEP1O95476 244 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 FAM189BP81408 668 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 INF2Q27J81 1249 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 MAP7D2Q96T17 732 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 CLDND1Q9NY35 253 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 AKT3Q9Y243 479 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 SLC37A4O43826 429 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 CSPG5O95196 566 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 GPC3P51654 580 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 ANAPC15P60006 121 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 HCSTQ9UBK5 93 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM150BA6NC51 233 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 CDKL5O76039 1030 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 COL9A1P20849 921 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 TMOD1P28289 359 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 IRS1P35568 1242 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 DRP2Q13474 957 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-250ENST00000434333 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 NCK2O43639 380 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 FGFR1P11362 822 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 AK2P54819 239 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 XKR3Q5GH77 459 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 OXER1Q8TDS5 423 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 POF1BQ8WVV4 589 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 RNF19AQ9NV58 838 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms