RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431312.2

DDX17-204, Transcript of DEAD-box helicase 17, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene DDX17, Length 1,853 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX17-204ENST00000431312 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.67□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 VAV3Q9UKW4 847 aa14.67□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 CFBP00751 764 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 SKOR1P84550 965 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 TBC1D5Q92609 795 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 PALMO75781 387 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 TNNC1P63316 161 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 GHRHRQ02643 423 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 EPHA7Q15375 998 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 LRRC31Q6UY01 552 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 SRLQ86TD4 932 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 WHAMMQ8TF30 809 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 KCND2Q9NZV8 630 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 A0A087X0T9 212 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 POTEFA5A3E0 1075 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 FAM228BP0C875 321 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 POTEIP0CG38 1075 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 UCHL3P15374 230 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 KLRC1P26715 233 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 INPP5BP32019 993 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 JAM2P57087 298 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 POTEGQ6S5H5 508 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 REEP2Q9BRK0 252 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 FAM107BQ9H098 131 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX17-204ENST00000431312 PARP14Q460N5 1801 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 C19orf81C9J6K1 198 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 FAM86B1E9PN63 330 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 HSF2BPO75031 334 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 ZBED4O75132 1171 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 FLOT1O75955 427 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 HOXD13P35453 343 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 HSD17B4P51659 736 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 VPS36Q86VN1 386 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 SFR1Q86XK3 245 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 C12orf42Q96LP6 360 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 WRNIP1Q96S55 665 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 GGA3Q9NZ52 723 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 ASTN1O14525 1302 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 FERP16591 822 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 VCAM1P19320 739 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 PON1P27169 355 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 BACE1P56817 501 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 MTMR2Q13614 643 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 MYBPC2Q14324 1141 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 USP38Q8NB14 1042 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 BORCS6Q96GS4 357 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 DRC1Q96MC2 740 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 ZNF536O15090 1300 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 MSH4O15457 936 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 NCK2O43639 380 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 ZMYND10O75800 440 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 NR3C1P04150 777 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 PTPRAP18433 802 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 RFX1P22670 979 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 STAT3P40763 770 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 PPP2R5CQ13362 524 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 IQCKQ8N0W5 287 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX17-204ENST00000431312 TAF4BQ92750 862 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms