RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428007.1

PAICSP3-201, Transcript of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene PAICSP3, Length 1,168 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 CCNE2O96020 404 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 OR52Z1P0C646 297 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 IQCF3P0C7M6 154 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 RSPH10BP0C881 870 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 INSRRP14616 1297 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 ABL2P42684 1182 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 PLCB4Q15147 1175 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 TCP11Q8WWU5 503 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 BADQ92934 168 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 MARVELD3Q96A59 401 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 MAP7D2Q96T17 732 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 FTHL17Q9BXU8 183 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.97□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PAICSP3-201ENST00000428007 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CARNS1A5YM72 827 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC37A4O43826 429 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 EDIL3O43854 480 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CXCL10P02778 98 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CKBP12277 381 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 SYN1P17600 705 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 SCP2P22307 547 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 RPA1P27694 616 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 MCM7P33993 719 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CHMP4BP1P59074 171 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 IKBKEQ14164 716 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 HERVK_113Q902F9 699 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 SEPT8Q92599 483 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 HAS1Q92839 578 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 NACC1Q96RE7 527 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 PCYT2Q99447 389 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 SETD4Q9NVD3 440 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 VAV3Q9UKW4 847 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.96□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 POM121CA8CG34 1229 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 KIF28PB7ZC32 967 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 TREHO43280 583 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 STX6O43752 255 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CYP2C9P11712 490 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 SYT1P21579 422 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 KLRC1P26715 233 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 THPOP40225 353 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 TXKP42681 527 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 GUCY1B3Q02153 619 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 POU5F1BQ06416 359 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 KRT79Q5XKE5 535 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 TIPINQ9BVW5 301 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 KCND2Q9NZV8 630 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CFAP45Q9UL16 551 aa9.95□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 GPR182O15218 404 aa9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CHMP2AO43633 222 aa9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 DGAT1O75907 488 aa9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 SLITRK3O94933 977 aa9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CSF2RAP15509 400 aa9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 MARK3P27448 753 aa9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CYP2C18P33260 490 aa9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 ABCD1P33897 745 aa9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 USP46P62068 366 aa9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 PRKCEQ02156 737 aa9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 RAB30Q15771 203 aa9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms