RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC17Q96AE7 1141 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 TSC22D3Q99576 134 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPKQ9BS16 269 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 STOML1Q9UBI4 398 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 XDHP47989 1333 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 H0Y3Z8 333 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 DDIT3P35638 169 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 KLC3Q6P597 504 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 METTL23Q86XA0 190 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 AIFM3Q96NN9 605 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 PMLP29590 882 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC25Q96NG3 672 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 UBN1Q9NPG3 1134 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 PLAAQ9Y263 795 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ANO9A1A5B4 782 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT38O76015 456 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPA4LO95757 839 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNA1P78396 465 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF22Q14807 665 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 PROSER3Q2NL68 480 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 SARM1Q6SZW1 724 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 BCS1LQ9Y276 419 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 COPEO14579 308 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKAB2O43741 272 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 LMNAP02545 664 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 PLS3P13797 630 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 EPHB1P54762 984 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 MYO1EQ12965 1108 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ALCAMQ13740 583 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 SURF1Q15526 300 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ARMCX2Q7L311 632 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 IGSF1Q8N6C5 1336 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 NBPF3Q9H094 633 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 RASA4BC9J798 803 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 K7ERI5 159 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 RASA4O43374 803 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP5HO75947 161 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 SIK1P57059 783 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 TFDP2Q14188 446 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 DPP9Q86TI2 863 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ERICH1Q86X53 443 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 YY1AP1Q9H869 796 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 LARGE1O95461 756 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 MTERF2Q49AM1 385 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC26Q8NHZ8 85 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP36Q96G28 342 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC13A4Q9UKG4 626 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 M0R2C6 588 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 TJP3O95049 919 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 GYS2P54840 703 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ARL4CP56559 192 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 NR1H3Q13133 447 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ICE2Q659A1 982 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 PI16Q6UXB8 463 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 BTBD6Q96KE9 485 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP19Q96LK0 163 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 MXD3Q9BW11 206 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 SAYSD1Q9NPB0 183 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.521e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2-202ENST00000426333 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 GDAQ9Y2T3 454 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 CRB1P82279 1406 aa11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 APBA3O96018 575 aa11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 PYGBP11216 843 aa11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ARID5BQ14865 1188 aa11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 NECTIN1Q15223 517 aa11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 USPL1Q5W0Q7 1092 aa11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 LCORLQ8N3X6 602 aa11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 PI4K2BQ8TCG2 481 aa11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ATG3Q9NT62 314 aa11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms