RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 TOM1L1O75674 476 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SPDYE6P0CI01 402 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 MFAP3P55082 362 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 MAP3K7CLP57077 242 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 MMS19Q96T76 1030 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 YY1AP1Q9H869 796 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 USP17L8P0C7I0 530 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 PPP2R2AP63151 447 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PDIA6Q15084 440 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 RAPH1Q70E73 1250 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 LRRC14Q15048 493 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 C10orf76Q5T2E6 689 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 ADGRB2O60241 1585 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA8SH3BPF8 625 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ABL1P00519 1130 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PRCPP42785 496 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 METTL23Q86XA0 190 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf167Q5SNV9 1468 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 RFX6Q8HWS3 928 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 COA7Q96BR5 231 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 ATP8B3O60423 1300 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 CPP00450 1065 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 POLR2MP0CAP2 368 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 UBXN2AP68543 259 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SEPT2Q15019 361 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SLFN13Q68D06 897 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 VPS39Q96JC1 886 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB18Q99592 522 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 GGT7Q9UJ14 662 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 TBCCQ15814 346 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 TMC4Q7Z404 712 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ABI1Q8IZP0 508 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 METTL13Q8N6R0 699 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PIGSQ96S52 555 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.5□□□□□ -0.89
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