RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF720Q7Z2F6 126 aa25.2■■□□□ 1.63
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.2■■□□□ 1.63
RABGGTA-202ENST00000399409 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.2■■□□□ 1.63
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RABGGTA-202ENST00000399409 GOLGA6DP0CG33 693 aa25.2■■□□□ 1.62
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RABGGTA-202ENST00000399409 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-202ENST00000399409 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.19■■□□□ 1.62
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RABGGTA-202ENST00000399409 TBC1D12O60347 775 aa25.19■■□□□ 1.62
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RABGGTA-202ENST00000399409 FIZ1Q96SL8 496 aa25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-202ENST00000399409 RUFY1Q96T51 708 aa25.19■■□□□ 1.62
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RABGGTA-202ENST00000399409 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-202ENST00000399409 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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RABGGTA-202ENST00000399409 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.19■■□□□ 1.62
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RABGGTA-202ENST00000399409 DNA2P51530 1060 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-202ENST00000399409 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-202ENST00000399409 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.18■■□□□ 1.62
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RABGGTA-202ENST00000399409 TPCN2Q8NHX9 752 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-202ENST00000399409 STK33Q9BYT3 514 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-202ENST00000399409 EPB41L5Q9HCM4 733 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-202ENST00000399409 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-202ENST00000399409 KCNK3O14649 394 aa25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-202ENST00000399409 POLD1P28340 1107 aa25.17■■□□□ 1.62
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RABGGTA-202ENST00000399409 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.16■■□□□ 1.62
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RABGGTA-202ENST00000399409 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.16■■□□□ 1.62
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RABGGTA-202ENST00000399409 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.15■■□□□ 1.62
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RABGGTA-202ENST00000399409 SCFD2Q8WU76 684 aa25.15■■□□□ 1.62
RABGGTA-202ENST00000399409 NFU1Q9UMS0 254 aa25.15■■□□□ 1.62
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RABGGTA-202ENST00000399409 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa25.14■■□□□ 1.62
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RABGGTA-202ENST00000399409 ALCAMQ13740 583 aa25.14■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 PEX26Q7Z412 305 aa25.14■■□□□ 1.61
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