RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D5Q92609 795 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 WRNIP1Q96S55 665 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 FEZ1Q99689 392 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM5Q9C035 493 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 PICK1Q9NRD5 415 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 RMND1Q9NWS8 449 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 RLFQ13129 1914 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 MEIS1O00470 390 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 VWA5AO00534 786 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 MSH4O15457 936 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 CASP1P29466 404 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 TPM4P67936 248 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 FANCCQ00597 558 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 AMPD3Q01432 767 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 EHHADHQ08426 723 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 TLR1Q15399 786 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 SPATA1Q5VX52 437 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 KRT79Q5XKE5 535 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ISM2Q6H9L7 571 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC174Q6PII3 467 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 RAD54LQ92698 747 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 SLC5A5Q92911 643 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 CALML4Q96GE6 196 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM9Q9C026 710 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 VAV3Q9UKW4 847 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.74□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 MYMKA6NI61 221 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ZBED4O75132 1171 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 PSMD10O75832 226 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 FLOT1O75955 427 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 CFBP00751 764 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 MUTP22033 750 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 RPA1P27694 616 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 SSTR4P31391 388 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R2P41236 205 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 PPP2R5CQ13362 524 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 DGKZQ13574 1117 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ECM1Q16610 540 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 TKFCQ3LXA3 575 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 CEP55Q53EZ4 464 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 PRR16Q569H4 304 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 SV2BQ7L1I2 683 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 KCNK18Q7Z418 384 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ADSSL1Q8N142 457 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF592Q92610 1267 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 STAMQ92783 540 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 FANCLQ9NW38 375 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 COL20A1Q9P218 1284 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.337e-41■□□□□ 8.9
C6orf48-208ENST00000395788 PARP14Q460N5 1801 aa6.73□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.72□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 GLTPD2A6NH11 291 aa6.72□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 UNCXA6NJT0 531 aa6.72□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ADM5C9JUS6 153 aa6.72□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 NFIBO00712 420 aa6.72□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 CBFA2T2O43439 604 aa6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms