RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 TMX1Q9H3N1 280 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 ST18O60284 1047 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR32O75388 356 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 CALCRLQ16602 461 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 COL4A6Q14031 1691 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 LPXNO60711 386 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP2B1P20020 1258 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 ANO5Q75V66 913 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP89Q96ST8 783 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR182O15218 404 aa22.7■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 NEMFO60524 1076 aa22.7■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.7■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 EPHA7Q15375 998 aa22.7■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 ODR4Q5SWX8 454 aa22.7■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.7■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.7■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.7■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 DRP2Q13474 957 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM228AQ86W67 206 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 LXNQ9BS40 222 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 RGL1Q9NZL6 768 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 MGEA5O60502 916 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 GPC3P51654 580 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP4A11Q02928 519 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 FIBCD1Q8N539 461 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 DYDC2Q96IM9 177 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 SCLT1Q96NL6 688 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 SAMD11Q96NU1 681 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAM2Q99965 735 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 DENND3A2RUS2 1198 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 DGKIO75912 1065 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 STAG3L1P0CL83 205 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 MCM7P33993 719 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 TXKP42681 527 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 NPEPPSP55786 919 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 EPC2Q52LR7 807 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM192Q8IY95 271 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 ARID2Q68CP9 1835 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 DNM2P50570 870 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 C4orf19Q8IY42 314 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 IL27Q8NEV9 243 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 NLRP7Q8WX94 980 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 TMX3Q96JJ7 454 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP170P1Q96L14 293 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 MTMR9Q96QG7 549 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 RGS18Q9NS28 235 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 TPH2Q8IWU9 490 aa22.65■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.65■■□□□ 1.22
ANKRD39-201ENST00000393537 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms