RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377047.8

GPC6-201, Transcript of glypican 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC6, Length 6,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6-201ENST00000377047 CDC23Q9UJX2 597 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 PBKQ96KB5 322 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 POTEFA5A3E0 1075 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 POTEIP0CG38 1075 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 POTEGQ6S5H5 508 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 NBPF26B4DH59 902 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 STX1BP61266 288 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 DBN1Q16643 649 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 NBPF15Q8N660 670 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 ZMYND10O75800 440 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 KRT31Q15323 416 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 NEK9Q8TD19 979 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 LXNQ9BS40 222 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 BARHL2Q9NY43 387 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 BAG2O95816 211 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 NFKBIAP25963 317 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 IL9RQ01113 521 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 COASYQ13057 564 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 KCTD16Q68DU8 428 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 LDHDQ86WU2 507 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 PSMC5P62195 406 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 TMEM270Q6UE05 265 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 TTC25Q96NG3 672 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 ADAM22Q9P0K1 906 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 IFNAR2P48551 515 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 CEP120Q8N960 986 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 LRGUKQ96M69 825 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 F8W8V4 182 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 CASP1P29466 404 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 PCGF5Q86SE9 256 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 FDX1P10109 184 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 IL1RL1Q01638 556 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 GRIN3BO60391 1043 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 CYP27A1Q02318 531 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 LAMC1P11047 1609 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 CDC27P30260 824 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 BBS9Q3SYG4 887 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 SCARF1Q14162 830 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 M0QYV0 167 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 VSTM4Q8IW00 320 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 TBK1Q9UHD2 729 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 UBE4BO95155 1302 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 NDUFA10O95299 355 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 TMCO4Q5TGY1 634 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 MT-ND3P03897 115 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 CPB1P15086 417 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 RWDD2BP57060 319 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 RCN2Q14257 317 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 LRRC31Q6UY01 552 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 FAF2Q96CS3 445 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC6-201ENST00000377047 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms