RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 ARMC3Q5W041 872 aa23.55■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 DYMQ7RTS9 669 aa23.55■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.55■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 DYDC1Q8WWB3 177 aa23.55■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 IFT43Q96FT9 208 aa23.55■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 NENFQ9UMX5 172 aa23.55■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.55■■□□□ 1.36
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OPN3-201ENST00000366554 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.54■■□□□ 1.36
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OPN3-201ENST00000366554 OR52E8Q6IFG1 317 aa23.53■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa23.53■■□□□ 1.36
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OPN3-201ENST00000366554 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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OPN3-201ENST00000366554 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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OPN3-201ENST00000366554 RIPK2O43353 540 aa23.52■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 RNF220Q5VTB9 566 aa23.52■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 CGB2Q6NT52 195 aa23.52■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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OPN3-201ENST00000366554 CKAP2Q8WWK9 683 aa23.52■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 BICD1Q96G01 975 aa23.52■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.52■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 TRIM4Q9C037 500 aa23.52■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 STK17AQ9UEE5 414 aa23.52■■□□□ 1.36
OPN3-201ENST00000366554 TMEM120BA0PK00 339 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 COPB2P35606 906 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 BCAMP50895 628 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 CUL3Q13618 768 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 CEP63Q96MT8 703 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 RFC5P40937 340 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 MAPK7Q13164 816 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 VSTM1Q6UX27 236 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
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OPN3-201ENST00000366554 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 KLHL14Q9P2G3 628 aa23.51■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 DNAJC9Q8WXX5 260 aa23.5■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 PNMA5Q96PV4 448 aa23.5■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.5■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 TXLNGQ9NUQ3 528 aa23.5■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 AMFRQ9UKV5 643 aa23.5■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
OPN3-201ENST00000366554 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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