RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.65■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 SHC4Q6S5L8 630 aa22.65■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 OTUD5Q96G74 571 aa22.65■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 FAM20AQ96MK3 541 aa22.65■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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SMURF1-201ENST00000361125 ARMCX2Q7L311 632 aa22.65■■□□□ 1.22
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SMURF1-201ENST00000361125 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
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SMURF1-201ENST00000361125 JADE1Q6IE81 842 aa22.64■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.64■■□□□ 1.22
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SMURF1-201ENST00000361125 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.64■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
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SMURF1-201ENST00000361125 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.64■■□□□ 1.22
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SMURF1-201ENST00000361125 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.64■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
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SMURF1-201ENST00000361125 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.64■■□□□ 1.21
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SMURF1-201ENST00000361125 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.64■■□□□ 1.21
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SMURF1-201ENST00000361125 FIS1Q9Y3D6 152 aa22.64■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.64■■□□□ 1.21
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SMURF1-201ENST00000361125 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC38Q502W7 563 aa22.64■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.63■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.63■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.63■■□□□ 1.21
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SMURF1-201ENST00000361125 MAPK6Q16659 721 aa22.63■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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SMURF1-201ENST00000361125 ESYT2A0FGR8 921 aa22.63■■□□□ 1.21
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SMURF1-201ENST00000361125 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.63■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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SMURF1-201ENST00000361125 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.63■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.63■■□□□ 1.21
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SMURF1-201ENST00000361125 BBS9Q3SYG4 887 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 FAM167AQ96KS9 214 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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SMURF1-201ENST00000361125 GPC3P51654 580 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF699Q32M78 642 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 C12orf60Q5U649 245 aa22.62■■□□□ 1.21
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SMURF1-201ENST00000361125 ZNF609O15014 1411 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 CASP2P42575 452 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 IQCB1Q15051 598 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.62■■□□□ 1.21
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SMURF1-201ENST00000361125 PLS3P13797 630 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 PROM2Q8N271 834 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 SAAL1Q96ER3 474 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 MXD3Q9BW11 206 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.62■■□□□ 1.21
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SMURF1-201ENST00000361125 NFU1Q9UMS0 254 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 SCINQ9Y6U3 715 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 TEX33O43247 280 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 SUN1O94901 812 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 FCER1AP12319 257 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 HSPA6P17066 643 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 CCZ1BP86790 482 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 GPC4O75487 556 aa22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ZBED1O96006 694 aa22.61■■□□□ 1.21
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