RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000346562.6

NPAS3-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPAS3, Length 5,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3-201ENST00000346562 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 FBXW4P57775 412 aa24.74■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 KRT80Q6KB66 452 aa24.74■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 CFLARO15519 480 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 PYGBP11216 843 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 ARL4CP56559 192 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 RASGRF1Q13972 1273 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 TAF11Q15544 211 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 TBCCQ15814 346 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 SCN4BQ8IWT1 228 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 C21orf2O43822 256 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 MMP10P09238 476 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 CXCR5P32302 372 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 MB21D1Q8N884 522 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 NCLNQ969V3 563 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 ACAP3Q96P50 834 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF302Q9NR11 478 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 NEMP1O14524 444 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 TFDP2Q14188 446 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 ALS2CLQ60I27 953 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 CEP19Q96LK0 163 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 TTLL4Q14679 1199 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 CRLF3Q8IUI8 442 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 VSTM4Q8IW00 320 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 TMEM35BQ8NCS4 154 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 RMDN3Q96TC7 470 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 KRT76Q01546 638 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 SUSD4Q5VX71 490 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.73■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 NDUFA10O95299 355 aa24.72■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 PTK2BQ14289 1009 aa24.72■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 ADAM22Q9P0K1 906 aa24.72■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 PI16Q6UXB8 463 aa24.72■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 UNC13DQ70J99 1090 aa24.72■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 NNTQ13423 1086 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 PODXLO00592 558 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 FAM182BQ5T319 152 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 BANK1Q8NDB2 785 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 RCOR1Q9UKL0 485 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 KPNA7A9QM74 516 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 PKP1Q13835 747 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 MXD3Q9BW11 206 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 FAM96AQ9H5X1 160 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 TRPA1O75762 1119 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 SFNP31947 248 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 LLGL1Q15334 1064 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 CDC25AP30304 524 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 KLHL29Q96CT2 875 aa24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 USP6P35125 1406 aa24.7■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 WDR91A4D1P6 747 aa24.7■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 ZMYND10O75800 440 aa24.7■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.7■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 SZRD1Q7Z422 152 aa24.7■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 MMP19Q99542 508 aa24.7■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 CYP26B1Q9NR63 512 aa24.7■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 DNAJC12Q9UKB3 198 aa24.7■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 ZHX2Q9Y6X8 837 aa24.7■■□□□ 1.55
NPAS3-201ENST00000346562 ECE2O60344 883 aa24.7■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 UBE4BO95155 1302 aa24.7■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 PIDD1Q9HB75 910 aa24.7■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 COPB2P35606 906 aa24.7■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 IMPG1Q17R60 797 aa24.7■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 TTC39CQ8N584 583 aa24.7■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 AFG1LQ8WV93 481 aa24.7■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 WRNIP1Q96S55 665 aa24.7■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.7■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.7■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 COPEO14579 308 aa24.69■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 ANP32DO95626 131 aa24.69■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 KCNQ4P56696 695 aa24.69■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 ANLNQ9NQW6 1124 aa24.69■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 CEP72Q9P209 647 aa24.69■■□□□ 1.54
NPAS3-201ENST00000346562 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms