RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 TGFB3P10600 412 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 CD46P15529 392 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 JUNDP17535 347 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ICAM3P32942 547 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMC5P62195 406 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 CNTN2Q02246 1040 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 EHHADHQ08426 723 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 COASYQ13057 564 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ARSHQ5FYA8 562 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR78Q5VTH9 848 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 CENPPQ6IPU0 288 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 OTUD6AQ7L8S5 288 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 CREBRFQ8IUR6 639 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM133AQ8N9E0 248 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 THAP9Q9H5L6 903 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 NMRK2Q9NPI5 230 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 BTBD19C9JJ37 291 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 STRNO43815 780 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM13AO94988 1023 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 PSAPP07602 524 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 GSK3AP49840 483 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 HUNKP57058 714 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVK-9P63128 1117 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVK-24P63145 666 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC63Q05C16 580 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 NR1I3Q14994 352 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 TCP11X2Q5H9J9 407 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 TTI2Q6NXR4 508 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 C4orf19Q8IY42 314 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 BANK1Q8NDB2 785 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP6V0A1Q93050 837 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP19Q99542 508 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 TXNRD2Q9NNW7 524 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 SEL1LQ9UBV2 794 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ODF2LQ9ULJ1 636 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR90Q96KV7 1748 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 MYH7BA7E2Y1 1941 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GTH6 734 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ASB14A6NK59 587 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNJ18B7U540 433 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 N4BP3O15049 544 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 PEX10O60683 326 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP2C8P10632 490 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNJ12Q14500 433 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 NEDD9Q14511 834 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 CST9Q5W186 159 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 SEPT14Q6ZU15 432 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 TMC6Q7Z403 805 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 VSTM4Q8IW00 320 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM43AQ8N2R8 423 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM151AQ8N4L1 468 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 BRI3BPQ8WY22 251 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 REEP2Q9BRK0 252 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 TIPINQ9BVW5 301 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 NRBP1Q9UHY1 535 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 SMCHD1A6NHR9 2005 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNA2P16389 499 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 PTGS1P23219 599 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 EDNRBP24530 442 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 GUCY2CP25092 1073 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 YWHABP31946 246 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 INHBEP58166 350 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC8AQ8IWT6 810 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 MYCT1Q8N699 235 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 HPS3Q969F9 1004 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 RUSC1Q9BVN2 902 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 PARVGQ9HBI0 331 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms