RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 PURAQ00577 322 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 PSMD2Q13200 908 aa26.63■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 DPCR1Q3MIW9 517 aa26.63■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 KLHDC9Q8NEP7 349 aa26.63■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 KAT2BQ92831 832 aa26.63■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 CAVIN2O95810 425 aa26.63■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 RSPH10BP0C881 870 aa26.63■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF131P52739 623 aa26.63■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa26.63■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 MAEAQ7L5Y9 396 aa26.63■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 RNF180Q86T96 592 aa26.62■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.61■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM26FQ5R3K3 315 aa26.61■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 LHX8Q68G74 356 aa26.61■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 DAW1Q8N136 415 aa26.61■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 MYCT1Q8N699 235 aa26.61■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 KIFAP3Q92845 792 aa26.61■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 SEL1LQ9UBV2 794 aa26.61■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 GDAQ9Y2T3 454 aa26.61■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 UNC93B1Q9H1C4 597 aa26.59■■□□□ 1.85
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC39A2Q9NP94 309 aa26.59■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 GAS2L3Q86XJ1 694 aa26.58■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 CHMP4BP1P59074 171 aa26.58■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 LRRC41Q15345 812 aa26.58■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 TBC1D7Q9P0N9 293 aa26.58■■□□□ 1.85
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CCDC71L-201ENST00000315965 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa26.57■■□□□ 1.84
CCDC71L-201ENST00000315965 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa26.57■■□□□ 1.84
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CCDC71L-201ENST00000315965 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa26.57■■□□□ 1.84
CCDC71L-201ENST00000315965 PPP1R2P41236 205 aa26.57■■□□□ 1.84
CCDC71L-201ENST00000315965 COBLL1Q53SF7 1204 aa26.57■■□□□ 1.84
CCDC71L-201ENST00000315965 RETREG2Q8NC44 543 aa26.57■■□□□ 1.84
CCDC71L-201ENST00000315965 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CCDC71L-201ENST00000315965 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CCDC71L-201ENST00000315965 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CCDC71L-201ENST00000315965 C22orf31O95567 290 aa26.56■■□□□ 1.84
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF165P49910 485 aa26.56■■□□□ 1.84
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM178BQ8IXR5 827 aa26.56■■□□□ 1.84
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