RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 C7orf25Q9BPX7 421 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 FBXO3Q9UK99 471 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 TDP2O95551 362 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYL1P05976 194 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 GJC1P36383 396 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 GALCP54803 685 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLS1Q14651 629 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 TTC8Q8TAM2 541 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 E9PMD0 336 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 RAB27AP51159 221 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRC63Q05C16 580 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CAVIN4Q5BKX8 364 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAJC9Q8WXX5 260 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERVK-5Q9HDB9 667 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CSF1RP07333 972 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 FERP16591 822 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZBTB16Q05516 673 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SCYL3Q8IZE3 742 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SYCE1Q8N0S2 351 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 COA7Q96BR5 231 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 DYDC2Q96IM9 177 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 FGD4Q96M96 766 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SCOCQ9UIL1 159 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIAA1024Q9UPX6 916 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC160A6NGH7 325 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPFIA2O75334 1257 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 NOL4O94818 638 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SERPINB4P48594 390 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAJC3Q13217 504 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRDM11Q9NQV5 511 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 DCTN4Q9UJW0 460 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 MRC1P22897 1456 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD62A6NC57 917 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CBX6O95503 412 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNFAIP3P21580 790 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPHB2P29323 1055 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SEPT2Q15019 361 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 NBPF20Q3BBV1 942 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNK18Q7Z418 384 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 GPBP1Q86WP2 473 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ACTRT1Q8TDG2 376 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 MEIS1O00470 390 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 THAP12O43422 761 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPOPO43791 374 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 COASYQ13057 564 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 C11orf91Q3C1V1 193 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SYT15Q9BQS2 421 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRC37A3O60309 1634 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 AFF2P51816 1311 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 UCHL3P15374 230 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNGA2Q16280 664 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PIGWQ7Z7B1 504 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 TOM1O60784 492 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 STAT1P42224 750 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMED2Q15363 201 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 KYNUQ16719 465 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRC8CQ8TDW0 803 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 UCMAQ8WVF2 138 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SFI1A8K8P3 1242 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCA5LO95447 670 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 BAG2O95816 211 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 AGTP01019 485 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PIGOQ8TEQ8 1089 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRC37BQ96QE4 947 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CYTH2Q99418 400 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 DIP2BQ9P265 1576 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 MMP13P45452 471 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHRNDQ07001 517 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 RIPK1Q13546 671 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms