RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HMGCRP04035 888 aa26.44■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAPK7Q13164 816 aa26.44■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa26.44■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NRBP1Q9UHY1 535 aa26.44■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa26.43■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KLHL10Q6JEL2 608 aa26.43■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SFR1Q86XK3 245 aa26.43■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZBTB10Q96DT7 871 aa26.43■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CEP89Q96ST8 783 aa26.43■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FANCLQ9NW38 375 aa26.43■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A6NJR5 290 aa26.42■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPFIA4O75335 1185 aa26.42■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC41Q15345 812 aa26.42■■□□□ 1.82
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MED15Q96RN5 788 aa26.42■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SEPT4O43236 478 aa26.42■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PGK1P00558 417 aa26.42■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DGKDQ16760 1214 aa26.42■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa26.42■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP8B4Q8TF62 1192 aa26.42■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26.42■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa26.42■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYH11P35749 1972 aa26.41■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZBTB42B2RXF5 422 aa26.41■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FANCCQ00597 558 aa26.41■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PXYLP1Q8TE99 480 aa26.41■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AP5M1Q9H0R1 490 aa26.41■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NRBP2Q9NSY0 501 aa26.41■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ERAP1Q9NZ08 941 aa26.41■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRPC6Q9Y210 931 aa26.41■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 INHAP05111 366 aa26.4■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CASP5P51878 434 aa26.4■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDLIM7Q9NR12 457 aa26.4■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCND2Q9NZV8 630 aa26.4■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IFNKQ9P0W0 207 aa26.4■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa26.4■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa26.4■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM13AO94988 1023 aa26.39■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHMP4BP1P59074 171 aa26.39■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGEF6Q15052 776 aa26.39■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM26FQ5R3K3 315 aa26.39■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM102BQ5T8I3 360 aa26.39■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SH3TC2Q8TF17 1288 aa26.39■■□□□ 1.82
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 H3BRB1 525 aa26.39■■□□□ 1.81
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STX17P56962 302 aa26.39■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPATA1Q5VX52 437 aa26.39■■□□□ 1.81
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTNND2Q9UQB3 1225 aa26.39■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 Q9Y3F1 56 aa26.39■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRK4P32298 578 aa26.38■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KAT2BQ92831 832 aa26.38■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM167AQ96KS9 214 aa26.38■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ODF2LQ9ULJ1 636 aa26.38■■□□□ 1.81
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF131P52739 623 aa26.37■■□□□ 1.81
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADSSL1Q8N142 457 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLAIN1Q8ND83 568 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FIZ1Q96SL8 496 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PARVGQ9HBI0 331 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CBFA2T2O43439 604 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DGAT1O75907 488 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYBP10242 640 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RARBP10826 455 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NMT1P30419 496 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CPT1AP50416 773 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC26A2P50443 739 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGBP1P78318 339 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DRP2Q13474 957 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM143Q96AN5 459 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 INSRRP14616 1297 aa26.36■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRMT2P55345 433 aa26.36■■□□□ 1.81
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