RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 SPTLC2O15270 562 aa24.28■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 NUCB2P80303 420 aa24.28■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 MGAT3Q09327 533 aa24.28■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.28■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.482e-7■■■□□ 15.1
SLC25A39-201ENST00000225308 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 DRP2Q13474 957 aa24.28■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 HYIQ5T013 277 aa24.28■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.28■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 NBNO60934 754 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 BMP8BP34820 402 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 RFC2P35250 354 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 NME8Q8N427 588 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 IL23AQ9NPF7 189 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP6R2O75170 966 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 RFC5P40937 340 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 GRB10Q13322 594 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 SPECC1Q5M775 1068 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 USP49Q70CQ1 688 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNK18Q7Z418 384 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 CABP7Q86V35 215 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 PNMA5Q96PV4 448 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 CFAP45Q9UL16 551 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 VTNP04004 478 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 ACRP10323 421 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 TMOD1P28289 359 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 UBA7P41226 1012 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 EPSTI1Q96J88 318 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP7D2Q96T17 732 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 CXCL10P02778 98 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 EMC2Q15006 297 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 IER5Q5VY09 327 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.475e-11■□□□□ 11.3
SLC25A39-201ENST00000225308 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 AKT3Q9Y243 479 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 E9PMD0 336 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 DGAT1O75907 488 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 PLIN2Q99541 437 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 RCOR1Q9UKL0 485 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC26A4O43511 780 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 PFKMP08237 780 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 KRT85P78386 507 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 KIZQ2M2Z5 673 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM240Q5SV17 173 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 C9orf50Q5SZB4 431 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRC15Q8TF66 581 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 DNM3Q9UQ16 869 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 M0QZ92 97 aa24.22■■□□□ 1.47
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SLC25A39-201ENST00000225308 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF365Q70YC5 407 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 MTRQ99707 1265 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 GINS2Q9Y248 185 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 EYA4O95677 639 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 DNM2P50570 870 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 LPIN1Q14693 890 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM143Q96AN5 459 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A39-201ENST00000225308 CALML4Q96GE6 196 aa24.21■■□□□ 1.47
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