RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220429.12

GABPB1-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1, Length 2,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GABPB1-201ENST00000220429 USP17L5A8MUK1 530 aa14.77□□□□□ -0.05
GABPB1-201ENST00000220429 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
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GABPB1-201ENST00000220429 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.76□□□□□ -0.05
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GABPB1-201ENST00000220429 IFT81Q8WYA0 676 aa14.74□□□□□ -0.05
GABPB1-201ENST00000220429 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
GABPB1-201ENST00000220429 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.74□□□□□ -0.05
GABPB1-201ENST00000220429 C6orf50Q9HD87 102 aa14.74□□□□□ -0.05
GABPB1-201ENST00000220429 SCOCQ9UIL1 159 aa14.74□□□□□ -0.05
GABPB1-201ENST00000220429 SNX12Q9UMY4 172 aa14.74□□□□□ -0.05
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