RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 WDR18Q9BV38 432 aa22.64■■□□□ 1.22
STRADB-201ENST00000194530 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 SHTN1A0MZ66 631 aa22.64■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 SLC20A2Q08357 652 aa22.64■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.64■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 SLC5A5Q92911 643 aa22.64■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 UBE4BO95155 1302 aa22.63■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.212e-7■■■■□ 21
STRADB-201ENST00000194530 TRIM66O15016 1216 aa22.63■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 CFBP00751 764 aa22.63■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.63■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 GJB7Q6PEY0 223 aa22.63■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 PEX26Q7Z412 305 aa22.63■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 CSRNP1Q96S65 589 aa22.63■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 ISCUQ9H1K1 167 aa22.63■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.63■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.63■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.63■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 POLR2MP0CAP2 368 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 GUCY2FP51841 1108 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 PRELPP51888 382 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 GNGT1P63211 74 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 AKT1S1Q96B36 256 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 POLD1P28340 1107 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 SOX5P35711 763 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 CUL1Q13616 776 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 METTL13Q8N6R0 699 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 NACC1Q96RE7 527 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 STK33Q9BYT3 514 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 KCND2Q9NZV8 630 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 CCDC188H7C350 402 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 CHMP2AO43633 222 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 STYK1Q6J9G0 422 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 ZNF233A6NK53 670 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 EVI5O60447 810 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 GAS7O60861 476 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 KRT14P02533 472 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 LMNB1P20700 586 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 FMO5P49326 533 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 ZNF131P52739 623 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 SCN9AQ15858 1988 aa22.61■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 H0YIN7 160 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 GOPCQ9HD26 462 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 DMAC2Q9NW81 257 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 CCDC172P0C7W6 258 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 GALCP54803 685 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 CORO7P57737 925 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 TRADDQ15628 312 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 FAM107BQ9H098 131 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 TMX2Q9Y320 296 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.6■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 F8VZ95 297 aa22.59■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 ZBTB39O15060 712 aa22.59■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 ECE1P42892 770 aa22.59■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 ERVK-9P63128 1117 aa22.59■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 PPP2R5AQ15172 486 aa22.59■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 CEP55Q53EZ4 464 aa22.59■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 DAAM2Q86T65 1068 aa22.59■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.59■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.59■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.59■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 FIZ1Q96SL8 496 aa22.59■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
STRADB-201ENST00000194530 GRIN2DO15399 1336 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms