RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Reep2Q8VCD6 254 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 March8Q9DBD2 286 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cntn6Q9JMB8 1028 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Etnk2A7MCT6 385 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf568E9PYI1 671 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Heatr4E9Q357 955 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gimap9G3X987 291 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnaseh1O70338 285 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mindy4Q3UQI9 744 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc85aQ5SP85 500 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdc37Q61081 379 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 CtsqQ91ZF4 343 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mettl7bQ9DD20 244 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Usp34Q6ZQ93 3582 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adamts19P59509 1210 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 AlcamQ61490 583 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp2r5aQ6PD03 486 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plppr4Q7TME0 766 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chtf18Q8BIW9 969 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sdr42e1Q9D665 394 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tekt1Q9DAJ2 418 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Egfl6Q9JJZ5 550 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt28A6BLY7 462 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 LxnP70202 222 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nudt16Q6P3D0 195 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Amer1Q7TS75 1132 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 TbckQ8BM85 762 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fgd4Q91ZT5 766 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dock2Q8C3J5 1828 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adgra2Q91ZV8 1336 aa12.88□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tarbp2P97473 365 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5169Q5M8P2 212 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr390Q8VEZ7 311 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Apopt1Q9CQW7 192 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smim10l2aA0A0B4J1F8 78 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lcmt1A0A0U1RNF2 332 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnh2O35219 1162 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Per1O35973 1291 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 VegfbP49766 207 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Epb41l4aP52963 686 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcf12Q61286 706 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 FcgrtQ61559 365 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt31Q61765 416 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankfy1Q810B6 1169 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf467Q8JZL0 594 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700016D06RikQ9DAA5 166 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gyg1Q9R062 333 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm11985A0A1B0GS61 206 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Apol6B7ZC55 329 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Magea4F2Z493 315 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col9a2Q07643 688 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xpnpep1Q6P1B1 623 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 SucoQ8C341 1250 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mettl24Q8CCB5 363 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eef1gQ9D8N0 437 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Akt3Q9WUA6 479 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pappa2E9PZ87 1789 aa12.87□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp957Q3UT76 567 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm1587Q3UT80 123 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp13a4Q5XF90 1193 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adam39Q7M762 756 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zbtb5Q7TQG0 670 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnph1Q80VJ3 173 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem87aQ8BXN9 555 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tas1r1Q99PG6 842 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Med10Q9CXU0 135 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q9CYI0 393 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 MsraQ9D6Y7 233 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phka1P18826 1241 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankrd24Q80VM7 985 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spice1Q8C804 860 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tc2nQ91XT6 489 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tas1r3Q925D8 858 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smco2Q9DA21 347 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx25Q9QY15 484 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vstm4T1NXB5 319 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam129cD3YZB0 591 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccnd2P30280 289 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmod1P49813 359 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccr1P51675 355 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 SlmapQ3URD3 845 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 NostrinQ6WKZ7 506 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klhl20Q8VCK5 604 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hic1Q9R1Y5 733 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Astn1Q61137 1302 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sbno2Q7TNB8 1349 aa12.86□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Jakmip2D3YXK0 820 aa12.85□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nptx2O70340 429 aa12.85□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clcn3P51791 818 aa12.85□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Anks1aP59672 1150 aa12.85□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdlim7Q3TJD7 457 aa12.85□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Oog4Q4G0C7 502 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.4 ms