RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P KSS1P14681 368 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P PDX1P16451 410 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YAP1P19880 650 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P REC107P21651 314 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SAN1P22470 610 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P AIM17P23180 465 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P DMC1P25453 334 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P DGR2P32330 852 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P CYS4P32582 507 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SIP2P34164 415 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MTR2P34232 184 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P TEF4P36008 412 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR062CP36025 268 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YKR073CP36153 106 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MTC4P38335 694 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ARN2P38724 620 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P BIG1P38813 335 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MTC6P38849 526 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MTW1P39731 289 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YER010CP40011 234 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P GAT2P40209 560 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P HPM1P40481 377 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ADO1P47143 340 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P AAD10P47182 288 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P TOS2P50078 622 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P BUD9P53226 547 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P TWF1P53250 332 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P COG2P53271 262 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SYF2P53277 215 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ARC35P53731 342 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MRP51Q02950 344 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RSC9Q03124 581 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RIM13Q03792 727 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD33Q04231 177 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P BUR2Q05949 395 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ARV1Q06541 321 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ARR1Q06596 294 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RDL2Q08742 149 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RSA1Q08932 381 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR202WQ08993 238 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P FLO9P39712 1322 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YAL064W-BO13512 126 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P HTA1P04911 132 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P HEM4P06174 275 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P TPK2P06245 380 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RAP1P11938 827 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P PDA1P16387 420 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ERD2P18414 219 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P CLB3P24870 427 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RER1P25560 188 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO91P27514 894 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YIM1P28625 365 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MDL1P33310 695 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P GDH2P33327 1092 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P LTV1P34078 463 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YKL187CP34231 750 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P COS9P36034 407 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RSM22P36056 628 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YKL077WP36081 392 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ROT2P38138 954 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P TDP1P38319 544 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P TRM5P38793 499 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YHR180WP38868 163 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YHR219WP38900 624 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P FAD1P38913 306 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P FAA2P39518 744 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SEN34P39707 275 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL195CP40168 261 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RFC4P40339 323 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YIL067CP40514 678 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MET28P40573 187 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P IMA5P40884 581 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P GPP1P41277 250 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YFL066CP43538 392 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P TRS85P46944 698 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YJR142WP47173 342 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P TOM22P49334 152 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P IMA1P53051 589 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P OGG1P53397 376 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P UBP2Q01476 1272 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL039WQ03080 316 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P DYN3Q04949 312 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SPO77Q06134 477 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RAF1Q06891 181 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P BRX1Q08235 291 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P BTS1Q12051 335 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YDL211CQ12121 372 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SLH1P53327 1967 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P THP2O13539 261 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P TIM9O74700 87 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MOD5P07884 428 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RPP1BP10622 106 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P GAL3P13045 520 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P TOP3P13099 656 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P THR1P17423 357 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P PET9P18239 318 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P PRP4P20053 465 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms