RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M KSS1P14681 368 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PDX1P16451 410 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YAP1P19880 650 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M REC107P21651 314 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SAN1P22470 610 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM17P23180 465 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M DMC1P25453 334 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M DGR2P32330 852 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M CYS4P32582 507 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SIP2P34164 415 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MTR2P34232 184 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TEF4P36008 412 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR062CP36025 268 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YKR073CP36153 106 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MTC4P38335 694 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ARN2P38724 620 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M BIG1P38813 335 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MTC6P38849 526 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MTW1P39731 289 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YER010CP40011 234 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M GAT2P40209 560 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M HPM1P40481 377 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ADO1P47143 340 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M AAD10P47182 288 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TOS2P50078 622 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M BUD9P53226 547 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TWF1P53250 332 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M COG2P53271 262 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SYF2P53277 215 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ARC35P53731 342 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MRP51Q02950 344 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RSC9Q03124 581 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RIM13Q03792 727 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD33Q04231 177 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M BUR2Q05949 395 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ARV1Q06541 321 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ARR1Q06596 294 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RDL2Q08742 149 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RSA1Q08932 381 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR202WQ08993 238 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M FLO9P39712 1322 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YAL064W-BO13512 126 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M HTA1P04911 132 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M HEM4P06174 275 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TPK2P06245 380 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RAP1P11938 827 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PDA1P16387 420 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ERD2P18414 219 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M CLB3P24870 427 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RER1P25560 188 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PHO91P27514 894 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YIM1P28625 365 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MDL1P33310 695 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M GDH2P33327 1092 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M LTV1P34078 463 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YKL187CP34231 750 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M COS9P36034 407 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RSM22P36056 628 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YKL077WP36081 392 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ROT2P38138 954 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TDP1P38319 544 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TRM5P38793 499 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR180WP38868 163 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR219WP38900 624 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M FAD1P38913 306 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M FAA2P39518 744 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SEN34P39707 275 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL195CP40168 261 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RFC4P40339 323 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YIL067CP40514 678 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MET28P40573 187 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M IMA5P40884 581 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M GPP1P41277 250 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YFL066CP43538 392 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TRS85P46944 698 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YJR142WP47173 342 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TOM22P49334 152 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M IMA1P53051 589 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M OGG1P53397 376 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M UBP2Q01476 1272 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL039WQ03080 316 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M DYN3Q04949 312 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SPO77Q06134 477 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RAF1Q06891 181 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M BRX1Q08235 291 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M BTS1Q12051 335 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL211CQ12121 372 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SLH1P53327 1967 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M THP2O13539 261 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TIM9O74700 87 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MOD5P07884 428 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RPP1BP10622 106 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M GAL3P13045 520 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TOP3P13099 656 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M THR1P17423 357 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PET9P18239 318 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PRP4P20053 465 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
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