RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K KSS1P14681 368 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PDX1P16451 410 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YAP1P19880 650 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K REC107P21651 314 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SAN1P22470 610 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K AIM17P23180 465 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K DMC1P25453 334 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K DGR2P32330 852 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K CYS4P32582 507 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SIP2P34164 415 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MTR2P34232 184 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TEF4P36008 412 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR062CP36025 268 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YKR073CP36153 106 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MTC4P38335 694 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ARN2P38724 620 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K BIG1P38813 335 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MTC6P38849 526 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MTW1P39731 289 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YER010CP40011 234 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K GAT2P40209 560 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K HPM1P40481 377 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ADO1P47143 340 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K AAD10P47182 288 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TOS2P50078 622 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K BUD9P53226 547 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TWF1P53250 332 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K COG2P53271 262 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SYF2P53277 215 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ARC35P53731 342 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MRP51Q02950 344 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RSC9Q03124 581 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RIM13Q03792 727 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD33Q04231 177 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K BUR2Q05949 395 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ARV1Q06541 321 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ARR1Q06596 294 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RDL2Q08742 149 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RSA1Q08932 381 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR202WQ08993 238 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K FLO9P39712 1322 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YAL064W-BO13512 126 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K HTA1P04911 132 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K HEM4P06174 275 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TPK2P06245 380 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RAP1P11938 827 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PDA1P16387 420 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ERD2P18414 219 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K CLB3P24870 427 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RER1P25560 188 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PHO91P27514 894 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YIM1P28625 365 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MDL1P33310 695 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K GDH2P33327 1092 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K LTV1P34078 463 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YKL187CP34231 750 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K COS9P36034 407 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RSM22P36056 628 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YKL077WP36081 392 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ROT2P38138 954 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TDP1P38319 544 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TRM5P38793 499 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR180WP38868 163 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR219WP38900 624 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K FAD1P38913 306 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K FAA2P39518 744 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SEN34P39707 275 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL195CP40168 261 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RFC4P40339 323 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YIL067CP40514 678 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MET28P40573 187 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K IMA5P40884 581 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K GPP1P41277 250 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YFL066CP43538 392 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TRS85P46944 698 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YJR142WP47173 342 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TOM22P49334 152 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K IMA1P53051 589 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K OGG1P53397 376 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K UBP2Q01476 1272 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL039WQ03080 316 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K DYN3Q04949 312 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SPO77Q06134 477 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RAF1Q06891 181 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K BRX1Q08235 291 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K BTS1Q12051 335 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YDL211CQ12121 372 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SLH1P53327 1967 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K THP2O13539 261 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TIM9O74700 87 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MOD5P07884 428 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RPP1BP10622 106 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K GAL3P13045 520 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TOP3P13099 656 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K THR1P17423 357 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PET9P18239 318 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PRP4P20053 465 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
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