RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J KSS1P14681 368 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PDX1P16451 410 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YAP1P19880 650 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J REC107P21651 314 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SAN1P22470 610 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM17P23180 465 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J DMC1P25453 334 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J DGR2P32330 852 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J CYS4P32582 507 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SIP2P34164 415 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MTR2P34232 184 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TEF4P36008 412 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR062CP36025 268 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YKR073CP36153 106 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MTC4P38335 694 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ARN2P38724 620 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J BIG1P38813 335 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MTC6P38849 526 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MTW1P39731 289 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YER010CP40011 234 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J GAT2P40209 560 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J HPM1P40481 377 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ADO1P47143 340 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J AAD10P47182 288 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TOS2P50078 622 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD9P53226 547 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TWF1P53250 332 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J COG2P53271 262 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SYF2P53277 215 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ARC35P53731 342 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MRP51Q02950 344 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RSC9Q03124 581 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RIM13Q03792 727 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD33Q04231 177 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J BUR2Q05949 395 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ARV1Q06541 321 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ARR1Q06596 294 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RDL2Q08742 149 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RSA1Q08932 381 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR202WQ08993 238 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J FLO9P39712 1322 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YAL064W-BO13512 126 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J HTA1P04911 132 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J HEM4P06174 275 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TPK2P06245 380 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RAP1P11938 827 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PDA1P16387 420 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ERD2P18414 219 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J CLB3P24870 427 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RER1P25560 188 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO91P27514 894 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YIM1P28625 365 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MDL1P33310 695 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J GDH2P33327 1092 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J LTV1P34078 463 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL187CP34231 750 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J COS9P36034 407 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RSM22P36056 628 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL077WP36081 392 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ROT2P38138 954 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TDP1P38319 544 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TRM5P38793 499 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR180WP38868 163 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR219WP38900 624 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J FAD1P38913 306 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J FAA2P39518 744 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SEN34P39707 275 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL195CP40168 261 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RFC4P40339 323 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL067CP40514 678 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MET28P40573 187 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J IMA5P40884 581 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J GPP1P41277 250 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YFL066CP43538 392 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TRS85P46944 698 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR142WP47173 342 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TOM22P49334 152 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J IMA1P53051 589 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J OGG1P53397 376 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J UBP2Q01476 1272 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL039WQ03080 316 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J DYN3Q04949 312 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SPO77Q06134 477 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RAF1Q06891 181 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J BRX1Q08235 291 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J BTS1Q12051 335 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL211CQ12121 372 aa2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SLH1P53327 1967 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J THP2O13539 261 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TIM9O74700 87 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MOD5P07884 428 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RPP1BP10622 106 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J GAL3P13045 520 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TOP3P13099 656 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J THR1P17423 357 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PET9P18239 318 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP4P20053 465 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
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