RNA–Protein interactions for RNA: YNL228W

YNL228W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL228W, Length 777 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL228W	YNL228W	HXT1	P32465	570 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	COT1	P32798	439 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	MYO3	P36006	1272 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	PMU1	P36069	295 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	GPX2	P38143	162 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	RIB5	P38145	238 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	PEX32	P38292	413 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	GEP4	P38812	185 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	RTT101	P47050	842 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	YNL050C	P53952	270 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	ATC1	Q04005	294 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	FMP42	Q04991	504 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	FMP16	Q12497	93 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	UNG1	P12887	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	ATR1	P13090	542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	ECT1	P33412	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	ASK1	P35734	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	YMR262W	P38430	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	ABM1	P47146	123 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	YNL260C	P53846	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	AHC1	Q12433	566 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	MRS3	P10566	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	FAR1	P21268	830 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	UTR1	P21373	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	NAS6	P50086	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL228W	YNL228W	RAD1	P06777	1100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	SPR1	P32603	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	ATO2	P32907	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	TIR2	P33890	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	IST2	P38250	946 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	ATG7	P38862	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	PET100	P38958	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	YIL169C	P40442	995 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	LST7	P53237	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	HER2	Q03557	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	RTT103	Q05543	409 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	GAT3	Q07928	141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	AYT1	Q12226	474 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	SPS22	P25380	463 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	YKL162C	P36052	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	NAT2	P37293	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	MIX23	P38162	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	IML3	P38265	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	YBR137W	P38276	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	YHK8	P38776	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	YHR182W	P38870	785 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	MET30	P39014	640 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	RBG1	P39729	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	DSE1	P40077	573 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	SCC4	P40090	624 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	JLP2	P40206	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	INA22	P40576	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	YGL242C	P53066	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	IBD2	P53892	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	BCP1	Q06338	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	GPI12	P23797	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	YCR043C	P25361	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	ATS1	P31386	333 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	COY1	P34237	679 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	MTC6	P38849	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	RCY1	P39531	840 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	RPR2	P40571	144 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	TAF6	P53040	516 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	COS1	P53822	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	GOR1	P53839	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	HXT11	P54862	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	NDE2	Q07500	545 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	SNA4	Q07549	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	RSR1	P13856	272 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL228W	YNL228W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.5 ms