RNA–Protein interactions for RNA: YJL037W

IRC18, Transcript of Protein involved in outer spore wall assembly, yeast

Gene IRC18, Length 675 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IRC18	YJL037W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	MAS2	P11914	482 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	POX1	P13711	748 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	SEC62	P21825	274 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	PDR3	P33200	976 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	DOA1	P36037	715 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	SPC34	P36131	295 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	ATM1	P40416	690 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	CFD1	P40558	293 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	GCD10	P41814	478 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	GTO1	P48239	356 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YIP1	P53039	248 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	APC4	Q04601	652 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	ERV41	Q04651	352 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	RRG8	Q06109	277 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	RRT8	Q08219	342 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YDR262W	Q12331	272 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	ORT1	Q12375	292 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	PNS1	Q12412	539 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	APC2	Q12440	853 aa		3.36	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YAR066W	P0CX18	203 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YHR214W	P0CX19	203 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	FRE1	P32791	686 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	ECM15	P35195	104 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	FRE2	P36033	711 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YKL070W	P36087	169 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	MRPL37	P36532	105 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YCR041W	P37265	110 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YBR056W	P38081	501 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	RTC2	P38279	296 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
IRC18	YJL037W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	SAD1	P43589	448 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	PMT5	P52867	743 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	PGA2	P53903	129 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	IRC15	Q02733	499 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	RSC9	Q03124	581 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	RSN1	Q03516	953 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	VPS74	Q06385	345 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	MRPL35	Q06678	367 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	VAC14	Q06708	880 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	SYO1	Q07395	620 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	LDS2	Q08218	356 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	TIP41	Q12199	356 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	FSH3	Q99369	266 aa		3.35	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	CLN3	P13365	580 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	LSB5	P25369	354 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YCR100C	P25606	316 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	ACH1	P32316	526 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YPT53	P36019	220 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	SCO2	P38072	301 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	PET100	P38958	111 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	LOH1	P47055	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	STE24	P47154	453 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	PHB2	P50085	310 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	MND1	P53102	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	FRE4	P53746	719 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YPL068C	Q02749	293 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	IZH1	Q03419	316 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	BET5	Q03630	159 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	ATC1	Q04005	294 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	CSM3	Q04659	317 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	OSW1	Q08692	278 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	SPO24	Q3E752	67 aa		3.34	□□□□□ -1.87
IRC18	YJL037W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
IRC18	YJL037W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
IRC18	YJL037W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
IRC18	YJL037W	YPS1	P32329	569 aa		3.33	□□□□□ -1.88
IRC18	YJL037W	COX13	P32799	129 aa		3.33	□□□□□ -1.88
IRC18	YJL037W	PPZ2	P33329	710 aa		3.33	□□□□□ -1.88
IRC18	YJL037W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.33	□□□□□ -1.88	not detected
IRC18	YJL037W	COY1	P34237	679 aa		3.33	□□□□□ -1.88
IRC18	YJL037W	HSM3	P38348	480 aa		3.33	□□□□□ -1.88
IRC18	YJL037W	SIP3	P38717	1229 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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