RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		18.65	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM205C	A6NFA0	338 aa		18.64	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	GJB5	O95377	273 aa		18.64	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP2B1	P20020	1258 aa		18.64	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	LPIN1	Q14693	890 aa		18.64	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	XKR3	Q5GH77	459 aa		18.64	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	POTED	Q86YR6	584 aa		18.64	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAP7D2	Q96T17	732 aa		18.64	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAD9A	Q99638	391 aa		18.64	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		18.64	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		18.64	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF862	O60290	1169 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	UPP2	O95045	317 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	C22orf31	O95567	290 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSMC5	P62195	406 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP2R5C	Q13362	524 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	CALCRL	Q16602	461 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ODR4	Q5SWX8	454 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	BANK1	Q8NDB2	785 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	AKT3	Q9Y243	479 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	INSL6	Q9Y581	213 aa		18.63	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAMA3	Q16787	3333 aa		18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	NEMF	O60524	1076 aa		18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGFBP4	P22692	258 aa		18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD52	P31358	61 aa		18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	PAK2	Q13177	524 aa		18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	UGCG	Q16739	394 aa		18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTERF2	Q49AM1	385 aa		18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		18.61	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNM2	P50570	870 aa		18.61	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	EPHA7	Q15375	998 aa		18.61	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		18.61	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	HAS1	Q92839	578 aa		18.61	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	TOP1MT	Q969P6	601 aa		18.61	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMX3	Q96JJ7	454 aa		18.61	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	YME1L1	Q96TA2	773 aa		18.61	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	CERS4	Q9HA82	394 aa		18.61	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	VAV3	Q9UKW4	847 aa		18.61	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	EML1	O00423	815 aa		18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPS6KA5	O75582	802 aa		18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	VTN	P04004	478 aa		18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	MCM7	P33993	719 aa		18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	TXK	P42681	527 aa		18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLCN3	P51790	818 aa		18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	TAP1	Q03518	808 aa		18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCLT1	Q96NL6	688 aa		18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	PADI3	Q9ULW8	664 aa		18.6	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ENPP3	O14638	875 aa		18.59	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR182	O15218	404 aa		18.59	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		18.59	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		18.59	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		18.59	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		18.59	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	GBF1	Q92538	1859 aa		18.58	■□□□□ 0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCHN	A4D1U4	455 aa		18.58	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		18.58	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDC42EP1	Q00587	391 aa		18.58	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		18.58	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		18.58	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TPH2	Q8IWU9	490 aa		18.58	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	OSMR	Q99650	979 aa		18.58	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		18.58	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035		H3BQV1	296 aa		18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56

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